seq1 = pF1KE1687.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE1687/gi568815594r_94199483.tfa (gi568815594r:94199483_94434629), 235147 bp

>pF1KE1687 597
>gi568815594r:94199483_94434629 (Chr4)

(complement)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-226  (116665-116757)   100% ->
227-336  (125887-125996)   100% ->
337-435  (132386-132484)   100% ->
436-597  (134986-135147)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAACTACAAACTCACTTATTTTAATATGAGGGGGAGAGCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAAACTACAAACTCACTTATTTTAATATGAGGGGGAGAGCAGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTCGTTACATATTTGCTTATTTGGACATACAGTATGAAGACCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTCGTTACATATTTGCTTATTTGGACATACAGTATGAAGACCACAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAACAAGCTGACTGGCCTGAAATCAAATCAA         CTCTCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 TAGAACAAGCTGACTGGCCTGAAATCAAATCAAGTA...AAGCTCTCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGGAAAAATCCCCATTTTGGAAGTTGATGGACTTACTCTTCACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116673 TTTGGAAAAATCCCCATTTTGGAAGTTGATGGACTTACTCTTCACCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTAGCAATAGCAAGATATTTGACCAAAAACACAG         ATTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 116723 CCTAGCAATAGCAAGATATTTGACCAAAAACACAGGTA...CAGATTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGAAACACAGAAATGGAACAATGTCATGTTGATGCTATTGTGGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125893 CTGGAAACACAGAAATGGAACAATGTCATGTTGATGCTATTGTGGACACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGATGATTTCATGTCATGTTTTCCTTGGGCAGAGAAAAAGCAAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125943 CTGGATGATTTCATGTCATGTTTTCCTTGGGCAGAGAAAAAGCAAGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAA         GAGCAGATGTTCAATGAGCTGCTCACGTATAATGCGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125993 GAAAGTA...TAGGAGCAGATGTTCAATGAGCTGCTCACGTATAATGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCATCTTATGCAAGACTTGGACACATATTTAGGGGGGAGAGAATGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132423 CTCATCTTATGCAAGACTTGGACACATATTTAGGGGGGAGAGAATGGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTGGTAACTCT         GTAACTTGGGCAGACTTCTACTGGGAGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 132473 ATTGGTAACTCTGTG...TAGGTAACTTGGGCAGACTTCTACTGGGAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTGCAGTACCACACTTTTGGTCTTTAAGCCTGACCTGTTAGACAACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135015 TTGCAGTACCACACTTTTGGTCTTTAAGCCTGACCTGTTAGACAACCATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAGGCTGGTGACTTTACGGAAGAAAGTCCAAGCCATTCCTGCCGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135065 CAAGGCTGGTGACTTTACGGAAGAAAGTCCAAGCCATTCCTGCCGTCGCT

    600     .    :    .    :    .    :
    565 AACTGGATAAAACGAAGGCCCCAAACCAAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 135115 AACTGGATAAAACGAAGGCCCCAAACCAAACTC