seq1 = pF1KE1684.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KE1684/gi568815579f_39168679.tfa (gi568815579f:39168679_39370010), 201332 bp

>pF1KE1684 588
>gi568815579f:39168679_39370010 (Chr19)

(complement)

1-180  (125044-125223)   100% ->
181-258  (125517-125594)   100% ->
259-408  (125854-126003)   100% ->
409-492  (126104-126187)   100% ->
493-588  (126281-126376)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGGGGACTGCATGCCAGTGCTGGTGCTGATGGCCGCAGTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125044 ATGACCGGGGACTGCATGCCAGTGCTGGTGCTGATGGCCGCAGTGCTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGACTGGAGCAGTTCCTGTCGCCAGGCTCCGCGGGGCTCTCCCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125094 CGTGACTGGAGCAGTTCCTGTCGCCAGGCTCCGCGGGGCTCTCCCGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGGGGCTGCCACATAGCCCAGTTCAAGTCCCTGTCTCCACAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125144 CAAGGGGCTGCCACATAGCCCAGTTCAAGTCCCTGTCTCCACAGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGCCTTTAAGAGGGCCAAAGATGCCTTA         GAAGAGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125194 CAGGCCTTTAAGAGGGCCAAAGATGCCTTAGTG...TAGGAAGAGTCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGCTGAAGGACTGCAAGTGCCGCTCCCGCCTCTTCCCCAGGACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125528 TCTGCTGAAGGACTGCAAGTGCCGCTCCCGCCTCTTCCCCAGGACCTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCTGAGGCAGCTGCAG         GTGAGGGAGCGCCCCGTGGCTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 125578 ACCTGAGGCAGCTGCAGGTG...CAGGTGAGGGAGCGCCCCGTGGCTTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGCTGAGCTGGCCCTGACGCTGAAGGTTCTGGAGGCCACCGCTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125878 GAGGCTGAGCTGGCCCTGACGCTGAAGGTTCTGGAGGCCACCGCTGACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACCCAGCCCTGGGGGATGTCTTGGACCAGCCCCTTCACACCCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125928 TGACCCAGCCCTGGGGGATGTCTTGGACCAGCCCCTTCACACCCTGCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATATCCTCTCCCAGCTCCGGGCCTGT         ATCCAGCCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 125978 ATATCCTCTCCCAGCTCCGGGCCTGTGTG...CAGATCCAGCCTCAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGCAGGGCCCAGGACCCGGGGCCGCCTCCACCATTGGCTGCACCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126119 ACGGCAGGGCCCAGGACCCGGGGCCGCCTCCACCATTGGCTGCACCGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAGGAGGCCCCAAAAAAG         GAGTCCCCTGGCTGCCTCGAGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 126169 CCAGGAGGCCCCAAAAAAGGTG...CAGGAGTCCCCTGGCTGCCTCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTCTGTCACCTTCAACCTCTTCCGCCTCCTCACGCGAGACCTGAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126303 CCTCTGTCACCTTCAACCTCTTCCGCCTCCTCACGCGAGACCTGAATTGT

    600     .    :    .    :
    565 GTTGCCAGCGGGGACCTGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||
 126353 GTTGCCAGCGGGGACCTGTGTGTC