seq1 = pF1KE1682.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KE1682/gi568815579r_45919241.tfa (gi568815579r:45919241_46123021), 203781 bp

>pF1KE1682 588
>gi568815579r:45919241_46123021 (Chr19)

(complement)

1-287  (100001-100287)   100% ->
288-409  (103375-103496)   100% ->
410-588  (103603-103781)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGCCGCTCTATGCTGCTTGCCTGGGCTCTCCCCAGCCTCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCGCCGCTCTATGCTGCTTGCCTGGGCTCTCCCCAGCCTCCTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCGGAGCGGCTCAGGAGACAGAAGACCCGGCCTGCTGCAGCCCCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTCGGAGCGGCTCAGGAGACAGAAGACCCGGCCTGCTGCAGCCCCATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCCGGAACGAGTGGAAGGCCCTGGCATCAGAGTGCGCCCAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCCGGAACGAGTGGAAGGCCCTGGCATCAGAGTGCGCCCAGCACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCTGCCCTTACGCTATGTGGTGGTATCGCACACGGCGGGCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCTGCCCTTACGCTATGTGGTGGTATCGCACACGGCGGGCAGCAGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACACCCCCGCCTCGTGCCAGCAGCAGGCCCGGAATGTGCAGCACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACACCCCCGCCTCGTGCCAGCAGCAGGCCCGGAATGTGCAGCACTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATGAAGACACTGGGCTGGTGCGACGTGGGCTACAA         CTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100251 ACATGAAGACACTGGGCTGGTGCGACGTGGGCTACAAGTG...CAGCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGATTGGAGAAGACGGGCTCGTATACGAGGGCCGTGGCTGGAACTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 CTGATTGGAGAAGACGGGCTCGTATACGAGGGCCGTGGCTGGAACTTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGTGCCCACTCAGGTCACTTATGGAACCCCATGTCCATTGGCATCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 GGGTGCCCACTCAGGTCACTTATGGAACCCCATGTCCATTGGCATCAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCATGGGCAACTACATGG         ATCGGGTGCCCACACCCCAGGCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103479 TCATGGGCAACTACATGGGTG...CAGATCGGGTGCCCACACCCCAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCCGGGCAGCCCAGGGTCTACTGGCCTGCGGTGTGGCTCAGGGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103626 ATCCGGGCAGCCCAGGGTCTACTGGCCTGCGGTGTGGCTCAGGGAGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGGTCCAACTATGTGCTCAAAGGACACCGGGATGTGCAGCGTACACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103676 GAGGTCCAACTATGTGCTCAAAGGACACCGGGATGTGCAGCGTACACTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCCAGGCAACCAGCTCTACCACCTCATCCAGAATTGGCCACACTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103726 CTCCAGGCAACCAGCTCTACCACCTCATCCAGAATTGGCCACACTACCGC

    600     .
    583 TCCCCC
        ||||||
 103776 TCCCCC