seq1 = pF1KE1680.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KE1680/gi568815583f_49324298.tfa (gi568815583f:49324298_49584501), 260204 bp

>pF1KE1680 582
>gi568815583f:49324298_49584501 (Chr15)

1-286  (100001-100286)   100% ->
287-390  (158854-158957)   100% ->
391-582  (160013-160204)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAAATGGATACTGACATGGATCCTGCCAACTTTGCTCTACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAAATGGATACTGACATGGATCCTGCCAACTTTGCTCTACAGATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCTTTCACATTATCTGTCTAGTGGGTACTATATCTTTAGCTTGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCTTTCACATTATCTGTCTAGTGGGTACTATATCTTTAGCTTGCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATGACTCCAGAGCAAATGGCTACAAATGTGAACTGTTCCAGCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATGACTCCAGAGCAAATGGCTACAAATGTGAACTGTTCCAGCCCTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGACACACAAGAAGTTATGATTACATGGAAGGAGGGGATATAAGAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGACACACAAGAAGTTATGATTACATGGAAGGAGGGGATATAAGAGTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGACTCTTCTGTCGAACACAGTGGTACCTGAGGATCGATAAAAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGACTCTTCTGTCGAACACAGTGGTACCTGAGGATCGATAAAAGAGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGTAAAAGGGACCCAAGAGATGAAGAATAATTACA         ATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100251 AAGTAAAAGGGACCCAAGAGATGAAGAATAATTACAGTA...CAGATATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGGAAATCAGGACAGTGGCAGTTGGAATTGTGGCAATCAAAGGGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158859 ATGGAAATCAGGACAGTGGCAGTTGGAATTGTGGCAATCAAAGGGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAGTGAATTCTATCTTGCAATGAACAAGGAAGGAAAACTCTATGCAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 158909 AAGTGAATTCTATCTTGCAATGAACAAGGAAGGAAAACTCTATGCAAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         AAAGAATGCAATGAAGATTGTAACTTCAAAGAACTAATTCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158959 TA...CAGAAAGAATGCAATGAAGATTGTAACTTCAAAGAACTAATTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAAACCATTACAACACATATGCATCAGCTAAATGGACACACAACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160055 GAAAACCATTACAACACATATGCATCAGCTAAATGGACACACAACGGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAAATGTTTGTTGCCTTAAATCAAAAGGGGATTCCTGTAAGAGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160105 GGAAATGTTTGTTGCCTTAAATCAAAAGGGGATTCCTGTAAGAGGAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAACGAAGAAAGAACAAAAAACAGCCCACTTTCTTCCTATGGCAATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160155 AAACGAAGAAAGAACAAAAAACAGCCCACTTTCTTCCTATGGCAATAACT