seq1 = pF1KE1678.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KE1678/gi568815579r_6486023.tfa (gi568815579r:6486023_6691002), 204980 bp

>pF1KE1678 579
>gi568815579r:6486023_6691002 (Chr19)

(complement)

1-162  (100001-100162)   100% ->
163-196  (100867-100900)   100% ->
197-579  (104598-104980)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGAGGAGGGTTCGGGCTGCTCGGTGCGGCGCAGGCCCTATGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGAGGAGGGTTCGGGCTGCTCGGTGCGGCGCAGGCCCTATGGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTCCTGCGGGCTGCTTTGGTCCCATTGGTCGCGGGCTTGGTGATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTCCTGCGGGCTGCTTTGGTCCCATTGGTCGCGGGCTTGGTGATCTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGGTGTGCATCCAGCGCTTCGCACAGGCTCAGCAGCAGCTGCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGTGGTGTGCATCCAGCGCTTCGCACAGGCTCAGCAGCAGCTGCCGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTCACTTGGG         TGGGACGTAGCTGAGCTGCAGCTGAATCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGTCACTTGGGGTG...CAGTGGGACGTAGCTGAGCTGCAGCTGAATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACAG         GACCTCAGCAGGACCCCAGGCTATACTGGCAGGGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100896 CACAGGTA...CAGGACCTCAGCAGGACCCCAGGCTATACTGGCAGGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCCAGCACTGGGCCGCTCCTTCCTCCATGGACCAGAGCTGGACAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 104634 GCCCAGCACTGGGCCGCTCCTTCCTGCATGGACCAGAGCTGGACAAGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCTACGTATCCATCGTGATGGCATCTACATGGTACACATCCAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104684 CAGCTACGTATCCATCGTGATGGCATCTACATGGTACACATCCAGGTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGGCCATCTGCTCCTCCACGACGGCCTCCAGGCACCACCCCACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104734 GCTGGCCATCTGCTCCTCCACGACGGCCTCCAGGCACCACCCCACCACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCCGTGGGAATCTGCTCTCCCGCCTCCCGTAGCATCAGCCTGCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104784 TGGCCGTGGGAATCTGCTCTCCCGCCTCCCGTAGCATCAGCCTGCTGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCAGCTTCCACCAAGGTTGTACCATTGCCTCCCAGCGCCTGACGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104834 CTCAGCTTCCACCAAGGTTGTACCATTGCCTCCCAGCGCCTGACGCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCCGAGGGGACACACTCTGCACCAACCTCACTGGGACACTTTTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104884 GGCCCGAGGGGACACACTCTGCACCAACCTCACTGGGACACTTTTGCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    533 CCCGAAACACTGATGAGACCTTCTTTGGAGTGCAGTGGGTGCGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104934 CCCGAAACACTGATGAGACCTTCTTTGGAGTGCAGTGGGTGCGCCCC