seq1 = pF1KE1667.tfa, 561 bp
seq2 = pF1KE1667/gi568815593r_115731807.tfa (gi568815593r:115731807_115941693), 209887 bp

>pF1KE1667 561
>gi568815593r:115731807_115941693 (Chr5)

(complement)

1-304  (100001-100304)   100% ->
305-441  (103930-104066)   100% ->
442-504  (109030-109092)   100% ->
505-561  (109831-109887)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTAGCCGGGAACACCAAGTTTCACTGTGTAATTGCGTCCCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTAGCCGGGAACACCAAGTTTCACTGTGTAATTGCGTCCCCCTACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCGCCTCCTTTGCGACGCTCCCTGGAGAAAAGCACGCCCACTGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCGCCTCCTTTGCGACGCTCCCTGGAGAAAAGCACGCCCACTGCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTCAGTCGCTACTTCCGCTCTCGAGTGTCTCCAAGCAAGATGGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTCAGTCGCTACTTCCGCTCTCGAGTGTCTCCAAGCAAGATGGCGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCGCAGTCTGTGTTGCAGCTTCCTACTTCAATTGCTGCTGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCGCAGTCTGTGTTGCAGCTTCCTACTTCAATTGCTGCTGGAGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGACTTACGGATGTCTCCCCAGAAACAACCACCCCGGAGCCCCCGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGACTTACGGATGTCTCCCCAGAAACAACCACCCCGGAGCCCCCGTCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCTGCAGTTTCCCCGGGAACAGAGGAACCTGCTGGCGACACCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCTGCAGTTTCCCCGGGAACAGAGGAACCTGCTGGCGACACCAAGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAA         TTGACATTTTGCTAAAGGCTGTGGGAGACACTCCTAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAAGTA...CAGTTGACATTTTGCTAAAGGCTGTGGGAGACACTCCTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TATGAAAACAAAGAAGTGGGCAGTAGAGCGAACACGAACCATCCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103967 TATGAAAACAAAGAAGTGGGCAGTAGAGCGAACACGAACCATCCAAGGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCATTGACTTCATCAAAAAGTTTCTTAAACTTGTGGCCTCAGAACAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104017 TCATTGACTTCATCAAAAAGTTTCTTAAACTTGTGGCCTCAGAACAGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442          TTTATTTATGTGAATCAGTCCTTTGCTCCTTCCCCAGACCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104067 GTA...TAGTTTATTTATGTGAATCAGTCCTTTGCTCCTTCCCCAGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGAAGTTGGAACTCTCTATGAG         TGTTTTGGCAGTGATGGTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109071 AGAAGTTGGAACTCTCTATGAGGTA...TAGTGTTTTGGCAGTGATGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .
    524 AACTGGTTTTACATTACTGCAAGTCTCAGGCGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109850 AACTGGTTTTACATTACTGCAAGTCTCAGGCGTGGGGA