seq1 = pF1KE1663.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KE1663/gi568815591r_129734940.tfa (gi568815591r:129734940_130052555), 317616 bp

>pF1KE1663 549
>gi568815591r:129734940_130052555 (Chr7)

(complement)

1-53  (100001-100053)   100% ->
54-130  (171585-171661)   100% ->
131-205  (172914-172988)   100% ->
206-245  (193615-193654)   100% ->
246-298  (194993-195045)   100% ->
299-427  (213221-213349)   100% ->
428-549  (217495-217616)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATCTCCCAGTCCGGGCAAGAGGCGGATGGACACGGACGTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATCTCCCAGTCCGGGCAAGAGGCGGATGGACACGGACGTGGTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCT         CATCGAGAGTAAACATGAGGTTACGATCCTGGGAGGAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGTA...TAGCATCGAGAGTAAACATGAGGTTACGATCCTGGGAGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTAATGAATTTGTAGTGAAGTTTTATGGACCACAAGGAA         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 171623 TTAATGAATTTGTAGTGAAGTTTTATGGACCACAAGGAAGTA...CAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCATATGAAGGCGGAGTATGGAAAGTTAGAGTGGACCTACCTGATAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172916 CCATATGAAGGCGGAGTATGGAAAGTTAGAGTGGACCTACCTGATAAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTTTCAAATCTCCATCTATAG         GATTCATGAATAAAATTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 172966 CCCTTTCAAATCTCCATCTATAGGTA...CAGGATTCATGAATAAAATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCCATCCCAACATTGATGAAGC         GTCAGGAACTGTGTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 193633 TCCATCCCAACATTGATGAAGCGTA...CAGGTCAGGAACTGTGTGTCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GATGTAATTAATCAAACTTGGACAGCTCTCTATG         ATCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 195012 GATGTAATTAATCAAACTTGGACAGCTCTCTATGGTG...CAGATCTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 CAATATATTTGAGTCCTTCCTGCCTCAGTTATTGGCCTATCCTAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213228 CAATATATTTGAGTCCTTCCTGCCTCAGTTATTGGCCTATCCTAACCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 TAGATCCTCTCAATGGTGACGCTGCAGCCATGTACCTCCACCGACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213278 TAGATCCTCTCAATGGTGACGCTGCAGCCATGTACCTCCACCGACCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GAATACAAGCAGAAAATTAAAG         AGTACATCCAGAAATACGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 213328 GAATACAAGCAGAAAATTAAAGGTA...CAGAGTACATCCAGAAATACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 CACGGAGGAGGCGCTGAAAGAACAGGAAGAGGGTACCGGGGACAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217514 CACGGAGGAGGCGCTGAAAGAACAGGAAGAGGGTACCGGGGACAGCTCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CGGAGAGCTCTATGTCTGACTTTTCCGAAGATGAGGCCCAGGATATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217564 CGGAGAGCTCTATGTCTGACTTTTCCGAAGATGAGGCCCAGGATATGGAG

    600 
    547 TTG
        |||
 217614 TTG