seq1 = pF1KE1661.tfa, 537 bp
seq2 = pF1KE1661/gi568815586r_68148802.tfa (gi568815586r:68148802_68353448), 204647 bp

>pF1KE1661 537
>gi568815586r:68148802_68353448 (Chr12)

(complement)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-252  (100620-100685)   100% ->
253-396  (100802-100945)   100% ->
397-462  (101871-101936)   100% ->
463-537  (104573-104647)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCCTGCAGAAATCTGTGAGCTCTTTCCTTATGGGGACCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCCCTGCAGAAATCTGTGAGCTCTTTCCTTATGGGGACCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAGCTGCCTCCTTCTCTTGGCCCTCTTGGTACAGGGAGGAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAGCTGCCTCCTTCTCTTGGCCCTCTTGGTACAGGGAGGAGCAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCCATCAGCTCCCACTGCAGGCTTGACAAGTCCAACTTCCAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCCATCAGCTCCCACTGCAGGCTTGACAAGTCCAACTTCCAGCAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATATCACCAACCGCACCTTCATGCTGGCTAAGGAG         GCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 TATATCACCAACCGCACCTTCATGCTGGCTAAGGAGGTA...CAGGCTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTGGCTGATAACAACACAGACGTTCGTCTCATTGGGGAGAAACTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100625 CTTGGCTGATAACAACACAGACGTTCGTCTCATTGGGGAGAAACTGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGGAGTCAGT         ATGAGTGAGCGCTGCTATCTGATGAAGCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100675 ACGGAGTCAGTGTA...CAGATGAGTGAGCGCTGCTATCTGATGAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCTGAACTTCACCCTTGAAGAAGTGCTGTTCCCTCAATCTGATAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 GTGCTGAACTTCACCCTTGAAGAAGTGCTGTTCCCTCAATCTGATAGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGCCTTATATGCAGGAGGTGGTGCCCTTCCTGGCCAGGCTCAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100882 CCAGCCTTATATGCAGGAGGTGGTGCCCTTCCTGGCCAGGCTCAGCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCTAAGCACATGT         CATATTGAAGGTGATGACCTGCATATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100932 GGCTAAGCACATGTGTA...TAGCATATTGAAGGTGATGACCTGCATATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGAGGAATGTGCAAAAGCTGAAGGACACAGTGAAAAAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101898 CAGAGGAATGTGCAAAAGCTGAAGGACACAGTGAAAAAGGTA...CAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGAGAGAGTGGAGAGATCAAAGCAATTGGAGAACTGGATTTGCTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104575 TGGAGAGAGTGGAGAGATCAAAGCAATTGGAGAACTGGATTTGCTGTTTA

    550     .    :    .    :
    515 TGTCTCTGAGAAATGCCTGCATT
        |||||||||||||||||||||||
 104625 TGTCTCTGAGAAATGCCTGCATT