seq1 = pF1KE1660.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KE1660/gi568815584f_23273119.tfa (gi568815584f:23273119_23475847), 202729 bp

>pF1KE1660 531
>gi568815584f:23273119_23475847 (Chr14)

1-278  (100001-100278)   100% ->
279-531  (102507-102759)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGGAGCGACCCAGATTAGGTGAGGACAGTTCTCTCATTAGCCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGGAGCGACCCAGATTAGGTGAGGACAGTTCTCTCATTAGCCTTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTACAGGTGGTTGCATTCTTGGCAATGGTCATGGGAACCCACACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTACAGGTGGTTGCATTCTTGGCAATGGTCATGGGAACCCACACCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACTGGCCCAGCTGCTGCCCCAGCAAAGGGCAGGACACCTCTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACTGGCCCAGCTGCTGCCCCAGCAAAGGGCAGGACACCTCTGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGAGGTGGAGCACTGTGCCTGTGCCTCCCCTAGAGCCTGCTAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGAGGTGGAGCACTGTGCCTGTGCCTCCCCTAGAGCCTGCTAGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCGCCACCCAGAGTCCTGTAGGGCCAGTGAAGATGGACCCCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCGCCACCCAGAGTCCTGTAGGGCCAGTGAAGATGGACCCCTCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGGGCCATCTCCCCCTGGAGATATGA         GTTGGACAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100251 GCAGGGCCATCTCCCCCTGGAGATATGAGTG...CAGGTTGGACAGAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGAACCGGCTCCCCCAGGACCTGTACCACGCCCGTTGCCTGTGCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102520 TTGAACCGGCTCCCCCAGGACCTGTACCACGCCCGTTGCCTGTGCCCGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGCGTCAGCCTACAGACAGGCTCCCACATGGACCCCCGGGGCAACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102570 CTGCGTCAGCCTACAGACAGGCTCCCACATGGACCCCCGGGGCAACTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCTGCTCTACCACAACCAGACTGTCTTCTACAGGCGGCCATGCCATGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 102620 AGCTGCTCTACCACAACCAGACTGTCTTCTACCGGCGGCCATGCCATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGAAGGGCACCCACAAGGGCTACTGCCTGGAGCGCAGGCTGTACCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 GAGAAGGGCACCCACAAGGGCTACTGCCTGGAGCGCAGGCTGTACCGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCCTTAGCTTGTGTGTGTGTGCGGCCCCGTGTGATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 TTCCTTAGCTTGTGTGTGTGTGCGGCCCCGTGTGATGGGC