seq1 = pF1KE1656.tfa, 519 bp
seq2 = pF1KE1656/gi568815590f_141322241.tfa (gi568815590f:141322241_141531041), 208801 bp

>pF1KE1656 519
>gi568815590f:141322241_141531041 (Chr8)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-198  (102808-102900)   100% ->
199-329  (104699-104829)   100% ->
330-404  (105510-105584)   100% ->
405-519  (108687-108801)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGATGAACCGCCCGGCCCCGGTGGAGGTGAGCTACAAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGATGAACCGCCCGGCCCCGGTGGAGGTGAGCTACAAACACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCTTCCTCATCACCCACAACCCCACCAACGCCACGCTCAGCACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCTTCCTCATCACCCACAACCCCACCAACGCCACGCTCAGCACCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAG         GACCTGAAGAAGTACGGGGCTACCACTGTGGTGCGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGAGGTG...CAGGACCTGAAGAAGTACGGGGCTACCACTGTGGTGCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTGTGAAGTGACCTATGACAAAACGCCGCTGGAGAAGGATGGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 GTGTGTGAAGTGACCTATGACAAAACGCCGCTGGAGAAGGATGGCATCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTTGTG         GACTGGCCGTTTGACGATGGGGCGCCCCCGCCCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102894 CGTTGTGGTG...TAGGACTGGCCGTTTGACGATGGGGCGCCCCCGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAAGGTAGTGGAAGACTGGCTGAGCCTGGTGAAGGCCAAGTTCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104733 GCAAGGTAGTGGAAGACTGGCTGAGCCTGGTGAAGGCCAAGTTCTGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCCCCGGCAGCTGCGTGGCTGTGCACTGCGTGGCGGGCCTGGGCCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104783 GCCCCCGGCAGCTGCGTGGCTGTGCACTGCGTGGCGGGCCTGGGCCGGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    330       GGCTCCAGTCCTTGTGGCGCTGGCCCTTATTGAGAGCGGGATGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104833 ...CAGGGCTCCAGTCCTTGTGGCGCTGGCCCTTATTGAGAGCGGGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTACGAGGACGCCATCCAGTTCATCCGCCA         GAAGCGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105554 AGTACGAGGACGCCATCCAGTTCATCCGCCAGTG...CAGGAAGCGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGAGCCATCAACAGCAAGCAGCTCACCTACCTGGAGAAATACCGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108697 GGAGCCATCAACAGCAAGCAGCTCACCTACCTGGAGAAATACCGGCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACAGAGGCTGCGGTTCAAAGACCCACACACGCACAAGACCCGGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108747 ACAGAGGCTGCGGTTCAAAGACCCACACACGCACAAGACCCGGTGCTGCG

    550     .
    515 TTATG
        |||||
 108797 TTATG