seq1 = pF1KE1655.tfa, 513 bp
seq2 = pF1KE1655/gi568815586r_68101848.tfa (gi568815586r:68101848_68325756), 223909 bp

>pF1KE1655 513
>gi568815586r:68101848_68325756 (Chr12)

(complement)

1-171  (100001-100171)   100% ->
172-228  (100257-100313)   100% ->
229-363  (100474-100608)   100% ->
364-429  (123674-123739)   100% ->
430-513  (123826-123909)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGTGAATTTCATTTTGAGGTGTGGGTTGCTGTTAGTCACTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGTGAATTTCATTTTGAGGTGTGGGTTGCTGTTAGTCACTCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTGCCATTGCCAAGCACAAGCAATCTTCCTTCACCAAAAGTTGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTGCCATTGCCAAGCACAAGCAATCTTCCTTCACCAAAAGTTGTTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGGGGAACATTGTCCCAAGCTGTTGACGCTCTCTATATCAAAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAAGGGGAACATTGTCCCAAGCTGTTGACGCTCTCTATATCAAAGCAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGCTCAAAGCAACGATTCCA         GAAGACCGCATAAAAAATAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 TGGCTCAAAGCAACGATTCCAGTA...TAGGAAGACCGCATAAAAAATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACGATTATTAAAAAAGAAAACAAAAAAGCAGTTTATG         AAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100277 ACGATTATTAAAAAAGAAAACAAAAAAGCAGTTTATGGTA...TAGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTGTCAATTTCAAGAACAGCTTCTGTCCTTCTTCATGGAAGACGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100478 ACTGTCAATTTCAAGAACAGCTTCTGTCCTTCTTCATGGAAGACGTTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTCAACTGCAATTGCAAGGCTGCAAGAAAATACGCTTTGTGGAGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100528 GGTCAACTGCAATTGCAAGGCTGCAAGAAAATACGCTTTGTGGAGGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCATAGCCTTAGGCAGAAATTGAGCCACTGT         ATTTCCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100578 TCATAGCCTTAGGCAGAAATTGAGCCACTGTGTA...TAGATTTCCTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTCATCAGCTAGAGAGATGAAATCCATTACCAGGATGAAAAGAATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123684 CTTCATCAGCTAGAGAGATGAAATCCATTACCAGGATGAAAAGAATATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATAGG         ATTGGAAACAAAGGAATCTACAAAGCCATCAGTGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123734 TATAGGGTA...CAGATTGGAAACAAAGGAATCTACAAAGCCATCAGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    465 ACTGGATATTCTTCTTTCCTGGATTAAAAAATTATTGGAAAGCAGTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123861 ACTGGATATTCTTCTTTCCTGGATTAAAAAATTATTGGAAAGCAGTCAG