seq1 = pF1KE1651.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KE1651/gi568815578f_24849506.tfa (gi568815578f:24849506_25059709), 210204 bp

>pF1KE1651 435
>gi568815578f:24849506_25059709 (Chr20)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-243  (107782-107954)   100% ->
244-360  (109423-109539)   99% ->
361-435  (110130-110204)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGAGCGGCTGGAACTCTGCTGGCCTTCTGCTGCCTGGTCTTGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGAGCGGCTGGAACTCTGCTGGCCTTCTGCTGCCTGGTCTTGAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGGGGGCCCTTCCCCAG         ATACTTGTTCCCAGGACCTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CACTGGGGGCCCTTCCCCAGGTA...CAGATACTTGTTCCCAGGACCTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTCACGTGTGAAGCCAGGATTTCCTAAAACAATAAAGACCAATGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107803 ACTCACGTGTGAAGCCAGGATTTCCTAAAACAATAAAGACCAATGACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGTCCTCCAAGCAGCCAGATACAGTGTTGAAAAGTTCAACAACTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107853 GGAGTCCTCCAAGCAGCCAGATACAGTGTTGAAAAGTTCAACAACTGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAACGACATGTTCTTGTTCAAGGAGTCCCGCATCACAAGGGCCCTAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107903 GAACGACATGTTCTTGTTCAAGGAGTCCCGCATCACAAGGGCCCTAGTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AG         ATAGTGAAAGGCCTGAAATATATGCTCGAGGTGGAAATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 107953 AGGTA...CAGATAGTGAAAGGCCTGAAATATATGCTGGAGGTGGAAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCAGAACTACCTGCAAGAAAAACCAGCACCTGCGTCTGGATGACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109462 GGCAGAACTACCTGCAAGAAAAACCAGCACCTGCGTCTGGATGACTGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTCCAAACCAACCACACCTTGAAGCAG         ACTCTGAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109512 CTTCCAAACCAACCACACCTTGAAGCAGGTA...CAGACTCTGAGCTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTCTGAAGTCTGGGTCGTGCCCTGGCTCCAGCACTTCGAGGTGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110143 ACTCTGAAGTCTGGGTCGTGCCCTGGCTCCAGCACTTCGAGGTGCCTGTT

    450     .    :
    424 CTCCGTTGTCAC
        ||||||||||||
 110193 CTCCGTTGTCAC