seq1 = pF1KE1650.tfa, 492 bp
seq2 = pF1KE1650/gi568815586r_122072415.tfa (gi568815586r:122072415_122273995), 201581 bp

>pF1KE1650 492
>gi568815586r:122072415_122273995 (Chr12)

(complement)

1-165  (99988-100152)   96% ->
166-492  (101255-101581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GGCCTCTCACTCAGGCCCCTCGACGTCTGTGCTCTTTCTGTTCTGCT
        ||-|  ||||| |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99988 ATCGTTCTCTCTC CAGGCCCCTCGACGTCTGTGCTCTTTCTGTTCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 GCCTGGGAGGCTGGCTGGCCTCCCACACGTTGCCCGTCCGTTTACTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100037 GCCTGGGAGGCTGGCTGGCCTCCCACACGTTGCCCGTCCGTTTACTACGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 CCAAGTGATGATGTACAGAAAATAGTCGAGGAATTACAGTCCCTCTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100087 CCAAGTGATGATGTACAGAAAATAGTCGAGGAATTACAGTCCCTCTCGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 GATGCTTTTGAAAGAT         GTGGAGGAAGAGAAGGGCGTGCTCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100137 GATGCTTTTGAAAGATGTG...CAGGTGGAGGAAGAGAAGGGCGTGCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 TGTCCCAGAATTACACGCTGCCGTGTCTCAGCCCTGACGCCCAGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101280 TGTCCCAGAATTACACGCTGCCGTGTCTCAGCCCTGACGCCCAGCCGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 AACAACATCCACAGCCCAGCCATCCGGGCATATCTCAAGACAATCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101330 AACAACATCCACAGCCCAGCCATCCGGGCATATCTCAAGACAATCAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 GCTAGACAACAAATCTGTTATTGATGAGATCATAGAGCACCTCGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101380 GCTAGACAACAAATCTGTTATTGATGAGATCATAGAGCACCTCGACAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341 TCATATTTCAAGATGCACCAGAAACAAACATTTCTGTGCCAACAGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101430 TCATATTTCAAGATGCACCAGAAACAAACATTTCTGTGCCAACAGACACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391 CATGAATGTAAACGCTTCATCCTGACTATTTCTCAACAGTTTTCAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101480 CATGAATGTAAACGCTTCATCCTGACTATTTCTCAACAGTTTTCAGAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    441 CATGGACCTCGCACTAAAATCATTGACCTCTGGAGCCCAACAGGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101530 CATGGACCTCGCACTAAAATCATTGACCTCTGGAGCCCAACAGGCCACCA

    500 
    491 CT
        ||
 101580 CT