seq1 = pF1KE1648.tfa, 492 bp
seq2 = pF1KE1648/gi568815578r_2982633.tfa (gi568815578r:2982633_3184674), 202042 bp

>pF1KE1648 492
>gi568815578r:2982633_3184674 (Chr20)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-322  (101497-101698)   100% ->
323-492  (101873-102042)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGACACCATGCTGCCCGCCTGCTTCCTCGGCCTACTGGCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGACACCATGCTGCCCGCCTGCTTCCTCGGCCTACTGGCCTTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCGCGTGCTACTTCCAGAACTGCCCGAGGGGCGGCAAGAGGGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCGCGTGCTACTTCCAGAACTGCCCGAGGGGCGGCAAGAGGGCCATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGACCTGGAGCTGAGACAG         TGCCTCCCCTGCGGCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 CCGACCTGGAGCTGAGACAGGTA...CAGTGCCTCCCCTGCGGCCCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAAAGGCCGCTGCTTCGGGCCCAGCATCTGCTGCGCGGACGAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101518 GGCAAAGGCCGCTGCTTCGGGCCCAGCATCTGCTGCGCGGACGAGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCTTCGTGGGCACGGCTGAGGCGCTGCGCTGCCAGGAGGAGAACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101568 CTGCTTCGTGGGCACGGCTGAGGCGCTGCGCTGCCAGGAGGAGAACTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCGTCGCCCTGCCAGTCCGGCCAGAAGGCGTGCGGGAGCGGGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101618 TGCCGTCGCCCTGCCAGTCCGGCCAGAAGGCGTGCGGGAGCGGGGGCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCGCCGCCTTCGGCGTTTGCTGCAACGACG         AGAGCTGCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101668 TGCGCCGCCTTCGGCGTTTGCTGCAACGACGGTG...CAGAGAGCTGCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACCGAGCCCGAGTGCCGCGAGGGCTTTCACCGCCGCGCCCGCGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101883 GACCGAGCCCGAGTGCCGCGAGGGCTTTCACCGCCGCGCCCGCGCCAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCGGAGCAACGCCACGCAGCTGGACGGGCCGGCCGGGGCCTTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101933 ACCGGAGCAACGCCACGCAGCTGGACGGGCCGGCCGGGGCCTTGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGGCTGGTGCAGCTGGCCGGGGCGCCCGAGCCCTTCGAGCCCGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101983 CGGCTGGTGCAGCTGGCCGGGGCGCCCGAGCCCTTCGAGCCCGCCCAGCC

    500     .    :
    483 CGACGCCTAC
        ||||||||||
 102033 CGACGCCTAC