seq1 = pF1KE1646.tfa, 483 bp
seq2 = pF1KE1646/gi568815585f_30635606.tfa (gi568815585f:30635606_30864103), 228498 bp

>pF1KE1646 483
>gi568815585f:30635606_30864103 (Chr13)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-170  (108455-108554)   100% ->
171-241  (116447-116517)   100% ->
242-323  (120339-120420)   100% ->
324-483  (128339-128498)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCAAGAAACTGTAGGCAATGTTGTCCTGTTGGCCATCGTCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCAAGAAACTGTAGGCAATGTTGTCCTGTTGGCCATCGTCACCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCAGCGTGGTCCAGAATG         GATTCTTTGCCCATAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CATCAGCGTGGTCCAGAATGGTA...CAGGATTCTTTGCCCATAAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCACGAAAGCAGGACCCAGAATGGGAGGAGCTTCCAGAGGACCGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108476 AGCACGAAAGCAGGACCCAGAATGGGAGGAGCTTCCAGAGGACCGGAACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGCCTTTGAGCGGGTCTACACTGCCAA         CCAGAACTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108526 CTTGCCTTTGAGCGGGTCTACACTGCCAAGTG...CAGCCAGAACTGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGATGCGTACCCCACTTTCCTCGCTGTGCTCTGGTCTGCGGGGCTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116459 AGATGCGTACCCCACTTTCCTCGCTGTGCTCTGGTCTGCGGGGCTACTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAGCCAAG         TTCCTGCTGCGTTTGCTGGACTGATGTACTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116509 GCAGCCAAGGTA...TAGTTCCTGCTGCGTTTGCTGGACTGATGTACTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGTGAGGCAAAAGTACTTTGTCGGTTACCTAGGAGAGAGAACGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120371 TTTGTGAGGCAAAAGTACTTTGTCGGTTACCTAGGAGAGAGAACGCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324          CACCCCTGGCTACATATTTGGGAAACGCATCATACTCTTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120421 GTA...CAGCACCCCTGGCTACATATTTGGGAAACGCATCATACTCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGTTCCTCATGTCCGTTGCTGGCATATTCAACTATTACCTCATCTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128380 TGTTCCTCATGTCCGTTGCTGGCATATTCAACTATTACCTCATCTTCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTCGGAAGTGACTTTGAAAACTACATAAAGACGATCTCCACCACCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128430 TTCGGAAGTGACTTTGAAAACTACATAAAGACGATCTCCACCACCATCTC

    500     .    :    .
    465 CCCTCTACTTCTCATTCCC
        |||||||||||||||||||
 128480 CCCTCTACTTCTCATTCCC