seq1 = pF1KE1631.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KE1631/gi568815584f_20593565.tfa (gi568815584f:20593565_20794005), 200441 bp

>pF1KE1631 441
>gi568815584f:20593565_20794005 (Chr14)

1-441  (100001-100441)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGATGGGCCTGGGCGTTTTGTTGTTGGTCTTCGTGCTGGGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGATGGGCCTGGGCGTTTTGTTGTTGGTCTTCGTGCTGGGTCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGACCCCACCGACCCTGGCTCAGGATAACTCCAGGTACACACACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGACCCCACCGACCCTGGCTCAGGATAACTCCAGGTACACACACTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGACCCAGCACTATGATGCCAAACCACAGGGCCGGGATGACAGATACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGACCCAGCACTATGATGCCAAACCACAGGGCCGGGATGACAGATACTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAAGCATCATGAGGAGACGGGGCCTGACCTCACCCTGCAAAGACATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAAGCATCATGAGGAGACGGGGCCTGACCTCACCCTGCAAAGACATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACATTTATTCATGGCAACAAGCGCAGCATCAAGGCCATCTGTGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACATTTATTCATGGCAACAAGCGCAGCATCAAGGCCATCTGTGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAATGGAAACCCTCACAGAGAAAACCTAAGAATAAGCAAGTCTTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAATGGAAACCCTCACAGAGAAAACCTAAGAATAAGCAAGTCTTCTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGTCACCACTTGCAAGCTACATGGAGGGTCCCCCTGGCCTCCATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100301 CAGGTCACCACTTGCAAGCTACATGGAGGTTCCCCCTGGCCTCCATGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACCGAGCCACAGCGGGGTTCAGAAACGTTGTTGTTGCTTGTGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACCGAGCCACAGCGGGGTTCAGAAACGTTGTTGTTGCTTGTGAAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTTACCTGTCCACTTGGATCAGTCAATTTTCCGTCGTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTTACCTGTCCACTTGGATCAGTCAATTTTCCGTCGTCCG