seq1 = pF1KE1630.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KE1630/gi568815593f_139500370.tfa (gi568815593f:139500370_139726798), 226429 bp

>pF1KE1630 441
>gi568815593f:139500370_139726798 (Chr5)

23-88  (100001-100066)   100% ->
89-120  (114217-114248)   100% ->
121-198  (114328-114405)   100% ->
199-304  (114492-114597)   100% ->
305-398  (122999-123092)   100% ->
399-441  (126387-126429)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     23 AGGAATTGAATGATCTGGCACGGGACCCTCCAGCACAGTGTTCAGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGGAATTGAATGATCTGGCACGGGACCCTCCAGCACAGTGTTCAGCAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     73 CCTGTTGGAGATGATA         TGTTCCATTGGCAAGCTACAATAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGTTGGAGATGATAGTA...CAGTGTTCCATTGGCAAGCTACAATAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 GGGGCCA         AATGACAGTCCCTATCAGGGTGGAGTATTTTTCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114242 GGGGCCAGTA...CAGAATGACAGTCCCTATCAGGGTGGAGTATTTTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    155 TGACAATTCATTTCCCAACAGATTACCCCTTCAAACCACCTAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114362 TGACAATTCATTTCCCAACAGATTACCCCTTCAAACCACCTAAGGTA...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199    GTTGCATTTACAACAAGAATTTATCATCCAAATATTAACAGTAATGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114489 TAGGTTGCATTTACAACAAGAATTTATCATCCAAATATTAACAGTAATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246 CAGCATTTGTCTTGATATTCTACGATCACAGTGGTCTCCAGCACTAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114539 CAGCATTTGTCTTGATATTCTACGATCACAGTGGTCTCCAGCACTAACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296 TTTCAAAAG         TACTCTTGTCCATCTGTTCTCTGTTGTGTGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 114589 TTTCAAAAGGTA...TAGTACTCTTGTCCATCTGTTCTCTGTTGTGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337 CCCAATCCAGATGATCCTTTAGTGCCTGAGATTGCTCGGATCTACAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123031 CCCAATCCAGATGATCCTTTAGTGCCTGAGATTGCTCGGATCTACAAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    387 AGATAGAGAAAA         GTACAACAGAATAGCTCGGGAATGGACTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 123081 AGATAGAGAAAAGTA...CAGGTACAACAGAATAGCTCGGGAATGGACTC

    450     .    :
    428 AGAAGTATGCGATG
        ||||||||||||||
 126416 AGAAGTATGCGATG