seq1 = pF1KE1626.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KE1626/gi568815586r_48467960.tfa (gi568815586r:48467960_48670020), 202061 bp

>pF1KE1626 426
>gi568815586r:48467960_48670020 (Chr12)

(complement)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-292  (100781-100939)   100% ->
293-368  (101429-101504)   100% ->
369-426  (102004-102061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTCTTTGTCCCTCTGTTCCTGGTGGGCATCCTGTTCCCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTCTTTGTCCCTCTGTTCCTGGTGGGCATCCTGTTCCCTGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCCAAGCAATTCACAAAATGTGAGCTGTCCCAGCTGCTGAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGCCAAGCAATTCACAAAATGTGAGCTGTCCCAGCTGCTGAAAGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGATGGTTATGGAGGCATCGCTTTGCCTGAAT         TGATCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 TAGATGGTTATGGAGGCATCGCTTTGCCTGAATGTG...CAGTGATCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCATGTTTCACACCAGTGGTTATGACACACAAGCCATAGTTGAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100789 ACCATGTTTCACACCAGTGGTTATGACACACAAGCCATAGTTGAAAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAAGCACGGAATATGGACTCTTCCAGATCAGTAATAAGCTTTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100839 TGAAAGCACGGAATATGGACTCTTCCAGATCAGTAATAAGCTTTGGTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAGCAGCCAGGTCCCTCAGTCAAGGAACATCTGTGACATCTCCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 AGAGCAGCCAGGTCCCTCAGTCAAGGAACATCTGTGACATCTCCTGTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 A         AGTTCCTGGATGATGACATTACTGATGACATAATGTGTGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100939 AGTG...CAGAGTTCCTGGATGATGACATTACTGATGACATAATGTGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGAAGATCCTGGATATTAAAGGAATTGACTACTG         GTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101469 CAAGAAGATCCTGGATATTAAAGGAATTGACTACTGGTG...CAGGTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCATAAAGCCCTCTGCACTGAGAAGCTGGAACAGTGGCTTTGTGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102009 CCCATAAAGCCCTCTGCACTGAGAAGCTGGAACAGTGGCTTTGTGAGAAG

    450 
    424 TTG
        |||
 102059 TTG