seq1 = pF1KE1621.tfa, 405 bp
seq2 = pF1KE1621/gi568815593r_6272506.tfa (gi568815593r:6272506_6478483), 205978 bp

>pF1KE1621 405
>gi568815593r:6272506_6478483 (Chr5)

(complement)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-206  (101235-101318)   100% ->
207-309  (104058-104160)   100% ->
310-405  (105883-105978)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGAAGTTTGACCACCTAGAGGAGCACCTGGAGAAGTTCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGAAGTTTGACCACCTAGAGGAGCACCTGGAGAAGTTCGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACATTCGGCAGCTCGGCATCATCGTCAGTGACTTCCAGCCCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACATTCGGCAGCTCGGCATCATCGTCAGTGACTTCCAGCCCAGCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCGGGCTCAACCAAAAGCT         GAATTTTATTGTTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 AGGCCGGGCTCAACCAAAAGCTGTG...CAGGAATTTTATTGTTACTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTACAGGATATTGACAAGTGCAGACAGCAGCTTCATGATATTACTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101254 TTACAGGATATTGACAAGTGCAGACAGCAGCTTCATGATATTACTGTACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTAGAAGTTTTTGA         ATATATAGATCAAGGTCGAAATCCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101304 GTTAGAAGTTTTTGAGTA...CAGATATATAGATCAAGGTCGAAATCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCTCTACACCAAAGAGTGCCTGGAGAGGGCTCTAGCTAAAAATGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104084 AGCTCTACACCAAAGAGTGCCTGGAGAGGGCTCTAGCTAAAAATGAGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTAAAGGCAAGATCGACACCATGAAG         AAATTTAAAAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104134 GTTAAAGGCAAGATCGACACCATGAAGGTA...TAGAAATTTAAAAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTGATTCAAGAACTTTCTAAAGTATTTCCGGAAGACATGGCTAAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105897 GTTGATTCAAGAACTTTCTAAAGTATTTCCGGAAGACATGGCTAAGTATC

    400     .    :    .    :    .    :
    374 GAAGCATCCGGGGGGAGGATCACCCGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105947 GAAGCATCCGGGGGGAGGATCACCCGCCTTCT