seq1 = pF1KE1618.tfa, 384 bp
seq2 = pF1KE1618/gi568815579f_18473301.tfa (gi568815579f:18473301_18675147), 201847 bp

>pF1KE1618 384
>gi568815579f:18473301_18675147 (Chr19)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-190  (100362-100448)   100% ->
191-293  (101570-101672)   100% ->
294-384  (101757-101847)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGATCTTTGTGAAGACCCTCACTGGCAAAACCATCACCCTTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGATCTTTGTGAAGACCCTCACTGGCAAAACCATCACCCTTGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCCCAGTGACACCATTGAGAATGTCAAAGCCAAAATTCAAGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCCCAGTGACACCATTGAGAATGTCAAAGCCAAAATTCAAGACAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGG         GTATCCCACCTGACCAGCAGCGTCTGATATTTGCCGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGTG...CAGGTATCCCACCTGACCAGCAGCGTCTGATATTTGCCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAACAGCTGGAGGATGGCCGCACTCTCTCAGACTACAACATCCAGAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100400 AAACAGCTGGAGGATGGCCGCACTCTCTCAGACTACAACATCCAGAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         AGTCCACCCTGCACCTGGTGTTGCGCCTGCGAGGTGGCATTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100450 TA...CAGAGTCCACCCTGCACCTGGTGTTGCGCCTGCGAGGTGGCATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAGCCTTCTCTCCGCCAGCTTGCCCAGAAATACAACTGCGACAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101612 TTGAGCCTTCTCTCCGCCAGCTTGCCCAGAAATACAACTGCGACAAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCTGCCGCAA         GTGCTATGCTCGCCTTCACCCTCGTGCTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101662 ATCTGCCGCAAGTA...CAGGTGCTATGCTCGCCTTCACCCTCGTGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACTGCCGCAAGAAGAAGTGTGGTCACACCAACAACCTGCGTCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 CAACTGCCGCAAGAAGAAGTGTGGTCACACCAACAACCTGCGTCCCAAGA

    400     .    :
    374 AGAAGGTCAAA
        |||||||||||
 101837 AGAAGGTCAAA