seq1 = pF1KE1615.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KE1615/gi568815597r_149786263.tfa (gi568815597r:149786263_149986640), 200378 bp

>pF1KE1615 378
>gi568815597r:149786263_149986640 (Chr1)

(complement)

1-378  (100001-100378)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGAACCGGCAAAATCCGCTCCGGCCCCTAAAAAGGGCTCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGAACCGGCAAAATCCGCTCCGGCCCCTAAAAAGGGCTCCAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCGTCACCAAAGCCCAGAAGAAAGACGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCGTCACCAAAGCCCAGAAGAAAGACGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAAGAGAGCTACTCCATCTACGTGTACAAGGTGCTGAAGCAGGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAAGAGAGCTACTCCATCTACGTGTACAAGGTGCTGAAGCAGGTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGACACCGGCATCTCGTCCAAGGCCATGGGCATCATGAACTCCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGACACCGGCATCTCGTCCAAGGCCATGGGCATCATGAACTCCTTCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACGACATCTTCGAGCGCATCGCGGGAGAGGCTTCCCGCCTGGCGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACGACATCTTCGAGCGCATCGCGGGAGAGGCTTCCCGCCTGGCGCACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACAAGCGCTCCACCATCACATCCCGCGAGATCCAGACGGCCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACAAGCGCTCCACCATCACATCCCGCGAGATCCAGACGGCCGTGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCTGCCCGGCGAGCTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCTGCCCGGCGAGCTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGCACCAA

    350     .    :    .    :    .
    351 GGCGGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAG