seq1 = pF1KE1611.tfa, 345 bp
seq2 = pF1KE1611/gi568815590r_97941804.tfa (gi568815590r:97941804_98145089), 203286 bp

>pF1KE1611 345
>gi568815590r:97941804_98145089 (Chr8)

(complement)

1-21  (99723-99743)   100% ->
22-167  (100002-100147)   100% ->
168-298  (102315-102445)   100% ->
299-345  (103240-103286)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGCCGCAAAGAAGACG         AAAAAGTCGCTGGAGTCGAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  99723 ATGGTGGCCGCAAAGAAGACGGTG...TAGAAAAAGTCGCTGGAGTCGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAACTCTAGGCTCCAACTCGTTATGAAAAGTGGGAAGTACGTCCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 CAACTCTAGGCTCCAACTCGTTATGAAAAGTGGGAAGTACGTCCTGGGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAAGCAGACTCTGAAGATGATCAGACAAGGCAAAGCGAAATTGGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100072 ACAAGCAGACTCTGAAGATGATCAGACAAGGCAAAGCGAAATTGGTCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCGCTAACAACTGCCCAGCTTTGAG         GAAATCTGAAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100122 CTCGCTAACAACTGCCCAGCTTTGAGGTA...AAGGAAATCTGAAATAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTACTATGCTATGTTGGCTAAAACTGGTGTCCATCACTACAGTGGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102330 GTACTATGCTATGTTGGCTAAAACTGGTGTCCATCACTACAGTGGCAATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATATTGAACTGGGCACAGCATGCGGAAAATACTACAGAGTGTGCACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102380 ATATTGAACTGGGCACAGCATGCGGAAAATACTACAGAGTGTGCACACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTATCATTGATCCAG         GTGACTCTGACATCATTAGAAGCAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102430 GCTATCATTGATCCAGGTA...TAGGTGACTCTGACATCATTAGAAGCAT

    350     .    :    .    :
    324 GCCAGAACAGACTGGTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||
 103265 GCCAGAACAGACTGGTGAAAAG