Result of SIM4 for
pF1KE1599
seq1 = pF1KE1599.tfa, 3495 bp
seq2 = pF1KE1599/gi568815597f_65465566.tfa (gi568815597f:65465566_65737012), 271447 bp
>pF1KE1599 3495
>gi568815597f:65465566_65737012 (Chr1)
1-40 (100001-100040) 100% ->
41-370 (104908-105237) 100% ->
371-494 (106761-106884) 100% ->
495-703 (127092-127300) 100% ->
704-849 (130883-131028) 100% ->
850-994 (133095-133239) 100% ->
995-1285 (135827-136117) 100% ->
1286-1403 (136278-136395) 100% ->
1404-1603 (139473-139672) 100% ->
1604-1752 (143188-143336) 100% ->
1753-1912 (144382-144541) 100% ->
1913-1995 (144649-144731) 100% ->
1996-2212 (150443-150659) 100% ->
2213-2395 (152399-152581) 100% ->
2396-2491 (154363-154458) 100% ->
2492-2597 (155788-155893) 100% ->
2598-2673 (157341-157416) 100% ->
2674-3495 (170626-171447) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGATTTGTCAAAAATTCTGTGTGGTTTTGTTACATTGGG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
100001 ATGATTTGTCAAAAATTCTGTGTGGTTTTGTTACATTGGGGTA...CAGA
50 . : . : . : . : . :
42 ATTTATTTATGTGATAACTGCGTTTAACTTGTCATATCCAATTACTCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104909 ATTTATTTATGTGATAACTGCGTTTAACTTGTCATATCCAATTACTCCTT
100 . : . : . : . : . :
92 GGAGATTTAAGTTGTCTTGCATGCCACCAAATTCAACCTATGACTACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104959 GGAGATTTAAGTTGTCTTGCATGCCACCAAATTCAACCTATGACTACTTC
150 . : . : . : . : . :
142 CTTTTGCCTGCTGGACTCTCAAAGAATACTTCAAATTCGAATGGACATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105009 CTTTTGCCTGCTGGACTCTCAAAGAATACTTCAAATTCGAATGGACATTA
200 . : . : . : . : . :
192 TGAGACAGCTGTTGAACCTAAGTTTAATTCAAGTGGTACTCACTTTTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105059 TGAGACAGCTGTTGAACCTAAGTTTAATTCAAGTGGTACTCACTTTTCTA
250 . : . : . : . : . :
242 ACTTATCCAAAACAACTTTCCACTGTTGCTTTCGGAGTGAGCAAGATAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105109 ACTTATCCAAAACAACTTTCCACTGTTGCTTTCGGAGTGAGCAAGATAGA
300 . : . : . : . : . :
292 AACTGCTCCTTATGTGCAGACAACATTGAAGGAAAGACATTTGTTTCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105159 AACTGCTCCTTATGTGCAGACAACATTGAAGGAAAGACATTTGTTTCAAC
350 . : . : . : . : . :
342 AGTAAATTCTTTAGTTTTTCAACAAATAG ATGCAAACTGGA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
105209 AGTAAATTCTTTAGTTTTTCAACAAATAGGTA...CAGATGCAAACTGGA
400 . : . : . : . : . :
383 ACATACAGTGCTGGCTAAAAGGAGACTTAAAATTATTCATCTGTTATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106773 ACATACAGTGCTGGCTAAAAGGAGACTTAAAATTATTCATCTGTTATGTG
450 . : . : . : . : . :
433 GAGTCATTATTTAAGAATCTATTCAGGAATTATAACTATAAGGTCCATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106823 GAGTCATTATTTAAGAATCTATTCAGGAATTATAACTATAAGGTCCATCT
500 . : . : . : . : . :
483 TTTATATGTTCT GCCTGAAGTGTTAGAAGATTCACCTCTGG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
106873 TTTATATGTTCTGTA...TAGGCCTGAAGTGTTAGAAGATTCACCTCTGG
550 . : . : . : . : . :
524 TTCCCCAAAAAGGCAGTTTTCAGATGGTTCACTGCAATTGCAGTGTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127121 TTCCCCAAAAAGGCAGTTTTCAGATGGTTCACTGCAATTGCAGTGTTCAT
600 . : . : . : . : . :
574 GAATGTTGTGAATGTCTTGTGCCTGTGCCAACAGCCAAACTCAACGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127171 GAATGTTGTGAATGTCTTGTGCCTGTGCCAACAGCCAAACTCAACGACAC
650 . : . : . : . : . :
624 TCTCCTTATGTGTTTGAAAATCACATCTGGTGGAGTAATTTTCCAGTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127221 TCTCCTTATGTGTTTGAAAATCACATCTGGTGGAGTAATTTTCCAGTCAC
700 . : . : . : . : . :
674 CTCTAATGTCAGTTCAGCCCATAAATATGG TGAAGCCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
127271 CTCTAATGTCAGTTCAGCCCATAAATATGGGTA...AAGTGAAGCCTGAT
750 . : . : . : . : . :
715 CCACCATTAGGTTTGCATATGGAAATCACAGATGATGGTAATTTAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130894 CCACCATTAGGTTTGCATATGGAAATCACAGATGATGGTAATTTAAAGAT
800 . : . : . : . : . :
765 TTCTTGGTCCAGCCCACCATTGGTACCATTTCCACTTCAATATCAAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130944 TTCTTGGTCCAGCCCACCATTGGTACCATTTCCACTTCAATATCAAGTGA
850 . : . : . : . : . :
815 AATATTCAGAGAATTCTACAACAGTTATCAGAGAA GCTGAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
130994 AATATTCAGAGAATTCTACAACAGTTATCAGAGAAGTA...CAGGCTGAC
900 . : . : . : . : . :
856 AAGATTGTCTCAGCTACATCCCTGCTAGTAGACAGTATACTTCCTGGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133101 AAGATTGTCTCAGCTACATCCCTGCTAGTAGACAGTATACTTCCTGGGTC
950 . : . : . : . : . :
906 TTCGTATGAGGTTCAGGTGAGGGGCAAGAGACTGGATGGCCCAGGAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133151 TTCGTATGAGGTTCAGGTGAGGGGCAAGAGACTGGATGGCCCAGGAATCT
1000 . : . : . : . : . :
956 GGAGTGACTGGAGTACTCCTCGTGTCTTTACCACACAAG AT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
133201 GGAGTGACTGGAGTACTCCTCGTGTCTTTACCACACAAGGTA...CAGAT
1050 . : . : . : . : . :
997 GTCATATACTTTCCACCTAAAATTCTGACAAGTGTTGGGTCTAATGTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135829 GTCATATACTTTCCACCTAAAATTCTGACAAGTGTTGGGTCTAATGTTTC
1100 . : . : . : . : . :
1047 TTTTCACTGCATCTATAAGAAGGAAAACAAGATTGTTCCCTCAAAAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135879 TTTTCACTGCATCTATAAGAAGGAAAACAAGATTGTTCCCTCAAAAGAGA
1150 . : . : . : . : . :
1097 TTGTTTGGTGGATGAATTTAGCTGAGAAAATTCCTCAAAGCCAGTATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135929 TTGTTTGGTGGATGAATTTAGCTGAGAAAATTCCTCAAAGCCAGTATGAT
1200 . : . : . : . : . :
1147 GTTGTGAGTGATCATGTTAGCAAAGTTACTTTTTTCAATCTGAATGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135979 GTTGTGAGTGATCATGTTAGCAAAGTTACTTTTTTCAATCTGAATGAAAC
1250 . : . : . : . : . :
1197 CAAACCTCGAGGAAAGTTTACCTATGATGCAGTGTACTGCTGCAATGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136029 CAAACCTCGAGGAAAGTTTACCTATGATGCAGTGTACTGCTGCAATGAAC
1300 . : . : . : . : . :
1247 ATGAATGCCATCATCGCTATGCTGAATTATATGTGATTG AT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
136079 ATGAATGCCATCATCGCTATGCTGAATTATATGTGATTGGTA...TAGAT
1350 . : . : . : . : . :
1288 GTCAATATCAATATCTCATGTGAAACTGATGGGTACTTAACTAAAATGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136280 GTCAATATCAATATCTCATGTGAAACTGATGGGTACTTAACTAAAATGAC
1400 . : . : . : . : . :
1338 TTGCAGATGGTCAACCAGTACAATCCAGTCACTTGCGGAAAGCACTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136330 TTGCAGATGGTCAACCAGTACAATCCAGTCACTTGCGGAAAGCACTTTGC
1450 . : . : . : . : . :
1388 AATTGAGGTATCATAG GAGCAGCCTTTACTGTTCTGATATT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
136380 AATTGAGGTATCATAGGTA...AAGGAGCAGCCTTTACTGTTCTGATATT
1500 . : . : . : . : . :
1429 CCATCTATTCATCCCATATCTGAGCCCAAAGATTGCTATTTGCAGAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139498 CCATCTATTCATCCCATATCTGAGCCCAAAGATTGCTATTTGCAGAGTGA
1550 . : . : . : . : . :
1479 TGGTTTTTATGAATGCATTTTCCAGCCAATCTTCCTATTATCTGGCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139548 TGGTTTTTATGAATGCATTTTCCAGCCAATCTTCCTATTATCTGGCTACA
1600 . : . : . : . : . :
1529 CAATGTGGATTAGGATCAATCACTCTCTAGGTTCACTTGACTCTCCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139598 CAATGTGGATTAGGATCAATCACTCTCTAGGTTCACTTGACTCTCCACCA
1650 . : . : . : . : . :
1579 ACATGTGTCCTTCCTGATTCTGTGG TGAAGCCACTGCCTCC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
139648 ACATGTGTCCTTCCTGATTCTGTGGGTA...TAGTGAAGCCACTGCCTCC
1700 . : . : . : . : . :
1620 ATCCAGTGTGAAAGCAGAAATTACTATAAACATTGGATTATTGAAAATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143204 ATCCAGTGTGAAAGCAGAAATTACTATAAACATTGGATTATTGAAAATAT
1750 . : . : . : . : . :
1670 CTTGGGAAAAGCCAGTCTTTCCAGAGAATAACCTTCAATTCCAGATTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143254 CTTGGGAAAAGCCAGTCTTTCCAGAGAATAACCTTCAATTCCAGATTCGC
1800 . : . : . : . : . :
1720 TATGGTTTAAGTGGAAAAGAAGTACAATGGAAG ATGTATGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
143304 TATGGTTTAAGTGGAAAAGAAGTACAATGGAAGGTA...CAGATGTATGA
1850 . : . : . : . : . :
1761 GGTTTATGATGCAAAATCAAAATCTGTCAGTCTCCCAGTTCCAGACTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144390 GGTTTATGATGCAAAATCAAAATCTGTCAGTCTCCCAGTTCCAGACTTGT
1900 . : . : . : . : . :
1811 GTGCAGTCTATGCTGTTCAGGTGCGCTGTAAGAGGCTAGATGGACTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144440 GTGCAGTCTATGCTGTTCAGGTGCGCTGTAAGAGGCTAGATGGACTGGGA
1950 . : . : . : . : . :
1861 TATTGGAGTAATTGGAGCAATCCAGCCTACACAGTTGTCATGGATATAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144490 TATTGGAGTAATTGGAGCAATCCAGCCTACACAGTTGTCATGGATATAAA
2000 . : . : . : . : . :
1911 AG TTCCTATGAGAGGACCTGAATTTTGGAGAATAATTAATG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144540 AGGTC...CAGTTCCTATGAGAGGACCTGAATTTTGGAGAATAATTAATG
2050 . : . : . : . : . :
1952 GAGATACTATGAAAAAGGAGAAAAATGTCACTTTACTTTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
144688 GAGATACTATGAAAAAGGAGAAAAATGTCACTTTACTTTGGAAGGTA...
2100 . : . : . : . : . :
1996 CCCCTGATGAAAAATGACTCATTGTGCAGTGTTCAGAGATATGTGAT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150440 CAGCCCCTGATGAAAAATGACTCATTGTGCAGTGTTCAGAGATATGTGAT
2150 . : . : . : . : . :
2043 AAACCATCATACTTCCTGCAATGGAACATGGTCAGAAGATGTGGGAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150490 AAACCATCATACTTCCTGCAATGGAACATGGTCAGAAGATGTGGGAAATC
2200 . : . : . : . : . :
2093 ACACGAAATTCACTTTCCTGTGGACAGAGCAAGCACATACTGTTACGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150540 ACACGAAATTCACTTTCCTGTGGACAGAGCAAGCACATACTGTTACGGTT
2250 . : . : . : . : . :
2143 CTGGCCATCAATTCAATTGGTGCTTCTGTTGCAAATTTTAATTTAACCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150590 CTGGCCATCAATTCAATTGGTGCTTCTGTTGCAAATTTTAATTTAACCTT
2300 . : . : . : . : . :
2193 TTCATGGCCTATGAGCAAAG TAAATATCGTGCAGTCACTCA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
150640 TTCATGGCCTATGAGCAAAGGTA...CAGTAAATATCGTGCAGTCACTCA
2350 . : . : . : . : . :
2234 GTGCTTATCCTTTAAACAGCAGTTGTGTGATTGTTTCCTGGATACTATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152420 GTGCTTATCCTTTAAACAGCAGTTGTGTGATTGTTTCCTGGATACTATCA
2400 . : . : . : . : . :
2284 CCCAGTGATTACAAGCTAATGTATTTTATTATTGAGTGGAAAAATCTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152470 CCCAGTGATTACAAGCTAATGTATTTTATTATTGAGTGGAAAAATCTTAA
2450 . : . : . : . : . :
2334 TGAAGATGGTGAAATAAAATGGCTTAGAATCTCTTCATCTGTTAAGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152520 TGAAGATGGTGAAATAAAATGGCTTAGAATCTCTTCATCTGTTAAGAAGT
2500 . : . : . : . : . :
2384 ATTATATCCATG ATCATTTTATCCCCATTGAGAAGTACCAG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
152570 ATTATATCCATGGTA...CAGATCATTTTATCCCCATTGAGAAGTACCAG
2550 . : . : . : . : . :
2425 TTCAGTCTTTACCCAATATTTATGGAAGGAGTGGGAAAACCAAAGATAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154392 TTCAGTCTTTACCCAATATTTATGGAAGGAGTGGGAAAACCAAAGATAAT
2600 . : . : . : . : . :
2475 TAATAGTTTCACTCAAG ATGATATTGAAAAACACCAGAGTG
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
154442 TAATAGTTTCACTCAAGGTA...CAGATGATATTGAAAAACACCAGAGTG
2650 . : . : . : . : . :
2516 ATGCAGGTTTATATGTAATTGTGCCAGTAATTATTTCCTCTTCCATCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155812 ATGCAGGTTTATATGTAATTGTGCCAGTAATTATTTCCTCTTCCATCTTA
2700 . : . : . : . : . :
2566 TTGCTTGGAACATTATTAATATCACACCAAAG AATGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
155862 TTGCTTGGAACATTATTAATATCACACCAAAGGTA...TAGAATGAAAAA
2750 . : . : . : . : . :
2607 GCTATTTTGGGAAGATGTTCCGAACCCCAAGAATTGTTCCTGGGCACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
157350 GCTATTTTGGGAAGATGTTCCGAACCCCAAGAATTGTTCCTGGGCACAAG
2800 . : . : . : . : . :
2657 GACTTAATTTTCAGAAG CCAGAAACGTTTGAGCATCTTTTT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
157400 GACTTAATTTTCAGAAGGTT...TAGCCAGAAACGTTTGAGCATCTTTTT
2850 . : . : . : . : . :
2698 ATCAAGCATACAGCATCAGTGACATGTGGTCCTCTTCTTTTGGAGCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170650 ATCAAGCATACAGCATCAGTGACATGTGGTCCTCTTCTTTTGGAGCCTGA
2900 . : . : . : . : . :
2748 AACAATTTCAGAAGATATCAGTGTTGATACATCATGGAAAAATAAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170700 AACAATTTCAGAAGATATCAGTGTTGATACATCATGGAAAAATAAAGATG
2950 . : . : . : . : . :
2798 AGATGATGCCAACAACTGTGGTCTCTCTACTTTCAACAACAGATCTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170750 AGATGATGCCAACAACTGTGGTCTCTCTACTTTCAACAACAGATCTTGAA
3000 . : . : . : . : . :
2848 AAGGGTTCTGTTTGTATTAGTGACCAGTTCAACAGTGTTAACTTCTCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170800 AAGGGTTCTGTTTGTATTAGTGACCAGTTCAACAGTGTTAACTTCTCTGA
3050 . : . : . : . : . :
2898 GGCTGAGGGTACTGAGGTAACCTATGAGGACGAAAGCCAGAGACAACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170850 GGCTGAGGGTACTGAGGTAACCTATGAGGACGAAAGCCAGAGACAACCCT
3100 . : . : . : . : . :
2948 TTGTTAAATACGCCACGCTGATCAGCAACTCTAAACCAAGTGAAACTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170900 TTGTTAAATACGCCACGCTGATCAGCAACTCTAAACCAAGTGAAACTGGT
3150 . : . : . : . : . :
2998 GAAGAACAAGGGCTTATAAATAGTTCAGTCACCAAGTGCTTCTCTAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170950 GAAGAACAAGGGCTTATAAATAGTTCAGTCACCAAGTGCTTCTCTAGCAA
3200 . : . : . : . : . :
3048 AAATTCTCCATTGAAGGATTCTTTCTCTAATAGCTCATGGGAGATAGAGG
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171000 AAATTCTCCGTTGAAGGATTCTTTCTCTAATAGCTCATGGGAGATAGAGG
3250 . : . : . : . : . :
3098 CCCAGGCATTTTTTATATTATCAGATCAGCATCCCAACATAATTTCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171050 CCCAGGCATTTTTTATATTATCAGATCAGCATCCCAACATAATTTCACCA
3300 . : . : . : . : . :
3148 CACCTCACATTCTCAGAAGGATTGGATGAACTTTTGAAATTGGAGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171100 CACCTCACATTCTCAGAAGGATTGGATGAACTTTTGAAATTGGAGGGAAA
3350 . : . : . : . : . :
3198 TTTCCCTGAAGAAAATAATGATAAAAAGTCTATCTATTATTTAGGGGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171150 TTTCCCTGAAGAAAATAATGATAAAAAGTCTATCTATTATTTAGGGGTCA
3400 . : . : . : . : . :
3248 CCTCAATCAAAAAGAGAGAGAGTGGTGTGCTTTTGACTGACAAGTCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171200 CCTCAATCAAAAAGAGAGAGAGTGGTGTGCTTTTGACTGACAAGTCAAGG
3450 . : . : . : . : . :
3298 GTATCGTGCCCATTCCCAGCCCCCTGTTTATTCACGGACATCAGAGTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171250 GTATCGTGCCCATTCCCAGCCCCCTGTTTATTCACGGACATCAGAGTTCT
3500 . : . : . : . : . :
3348 CCAGGACAGTTGCTCACACTTTGTAGAAAATAATATCAACTTAGGAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171300 CCAGGACAGTTGCTCACACTTTGTAGAAAATAATATCAACTTAGGAACTT
3550 . : . : . : . : . :
3398 CTAGTAAGAAGACTTTTGCATCTTACATGCCTCAATTCCAAACTTGTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171350 CTAGTAAGAAGACTTTTGCATCTTACATGCCTCAATTCCAAACTTGTTCT
3600 . : . : . : . : .
3448 ACTCAGACTCATAAGATCATGGAAAACAAGATGTGTGACCTAACTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171400 ACTCAGACTCATAAGATCATGGAAAACAAGATGTGTGACCTAACTGTG