seq1 = pF1KE1592.tfa, 1212 bp
seq2 = pF1KE1592/gi568815587r_104926261.tfa (gi568815587r:104926261_105144659), 218399 bp

>pF1KE1592 1212
>gi568815587r:104926261_105144659 (Chr11)

(complement)

1-274  (110180-110452)   98% ->
275-337  (111534-111596)   100% ->
338-453  (113380-113495)   100% ->
454-627  (114157-114330)   100% ->
628-862  (114761-114995)   100% ->
863-1006  (115393-115536)   100% ->
1007-1116  (117709-117818)   100% ->
1117-1212  (118304-118399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGACAAGGTCCTGAAGGAGAAGAGAAAGCTGTTTATCCGTTCCAT
        |  -| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110180 AAA CAGACAAGGTCCTGAAGGAGAAGAGAAAGCTGTTTATCCGTTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTGAAGGTACAATAAATGGCTTACTGGATGAATTATTACAGACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110229 GGGTGAAGGTACAATAAATGGCTTACTGGATGAATTATTACAGACAAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGAACAAGGAAGAGATGGAGAAAGTAAAACGTGAAAATGCTACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110279 TGCTGAACAAGGAAGAGATGGAGAAAGTAAAACGTGAAAATGCTACAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGATAAGACCCGAGCTTTGATTGACTCCGTTATTCCGAAAGGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110329 ATGGATAAGACCCGAGCTTTGATTGACTCCGTTATTCCGAAAGGGGCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCATGCCAAATTTGCATCACATACATTTGTGAAGAAGACAGTTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110379 GGCATGCCAAATTTGCATCACATACATTTGTGAAGAAGACAGTTACCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGGGACGCTGGGACTCTCAGCAG         ATCAAACATCTGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110429 CAGGGACGCTGGGACTCTCAGCAGGTA...TAGATCAAACATCTGGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACCTTAATATGCAAGACTCTCAAGGAGTACTTTCTTCCTTTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111551 TACCTTAATATGCAAGACTCTCAAGGAGTACTTTCTTCCTTTCCAGGTA.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338      CTCCTCAGGCAGTGCAGGACAACCCAGCTATGCCCACATCCTCAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111601 ..CAGCTCCTCAGGCAGTGCAGGACAACCCAGCTATGCCCACATCCTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTCAGAAGGGAATGTCAAGCTTTGCTCCCTAGAAGAAGCTCAAAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113425 GCTCAGAAGGGAATGTCAAGCTTTGCTCCCTAGAAGAAGCTCAAAGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGAAACAAAAGTCGGCAGAG         ATTTATCCAATAATGGACAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113475 TGGAAACAAAAGTCGGCAGAGGTG...CAGATTTATCCAATAATGGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCAAGCCGCACACGTCTTGCTCTCATTATCTGCAATGAAGAATTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114177 GTCAAGCCGCACACGTCTTGCTCTCATTATCTGCAATGAAGAATTTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTATTCCTAGAAGAACTGGAGCTGAGGTTGACATCACAGGCATGACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114227 GTATTCCTAGAAGAACTGGAGCTGAGGTTGACATCACAGGCATGACAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGCTACAAAATCTGGGGTACAGCGTAGATGTGAAAAAAAATCTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114277 CTGCTACAAAATCTGGGGTACAGCGTAGATGTGAAAAAAAATCTCACTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTCG         GACATGACTACAGAGCTGGAGGCATTTGCACACCGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114327 TTCGGTA...CAGGACATGACTACAGAGCTGGAGGCATTTGCACACCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGAGCACAAGACCTCTGACAGCACGTTCCTGGTGTTCATGTCTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114798 CAGAGCACAAGACCTCTGACAGCACGTTCCTGGTGTTCATGTCTCATGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATTCGGGAAGGCATTTGTGGGAAGAAACACTCTGAGCAAGTCCCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114848 ATTCGGGAAGGCATTTGTGGGAAGAAACACTCTGAGCAAGTCCCAGATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACTACAACTCAATGCAATCTTTAACATGTTGAATACCAAGAACTGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114898 ACTACAACTCAATGCAATCTTTAACATGTTGAATACCAAGAACTGCCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GTTTGAAGGACAAACCGAAGGTGATCATCATCCAGGCCTGCCGTGGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 114948 GTTTGAAGGACAAACCGAAGGTGATCATCATCCAGGCCTGCCGTGGTGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    863        ACAGCCCTGGTGTGGTGTGGTTTAAAGATTCAGTAGGAGTTTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114998 G...CAGACAGCCCTGGTGTGGTGTGGTTTAAAGATTCAGTAGGAGTTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGGAAACCTATCTTTACCAACTACAGAAGAGTTTGAGGATGATGCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115436 TGGAAACCTATCTTTACCAACTACAGAAGAGTTTGAGGATGATGCTATTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGAAAGCCCACATAGAGAAGGATTTTATCGCTTTCTGCTCTTCCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115486 AGAAAGCCCACATAGAGAAGGATTTTATCGCTTTCTGCTCTTCCACACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 G         ATAATGTTTCTTGGAGACATCCCACAATGGGCTCTGTTTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115536 GGTA...TAGATAATGTTTCTTGGAGACATCCCACAATGGGCTCTGTTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TATTGGAAGACTCATTGAACATATGCAAGAATATGCCTGTTCCTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117749 TATTGGAAGACTCATTGAACATATGCAAGAATATGCCTGTTCCTGTGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGAGGAAATTTTCCGCAAG         GTTCGATTTTCATTTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117799 TGGAGGAAATTTTCCGCAAGGTA...TAGGTTCGATTTTCATTTGAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCAGATGGTAGAGCGCAGATGCCCACCACTGAAAGAGTGACTTTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118325 CCAGATGGTAGAGCGCAGATGCCCACCACTGAAAGAGTGACTTTGACAAG

   1250     .    :    .    :    .
   1188 ATGTTTCTACCTCTTCCCAGGACAT
        |||||||||||||||||||||||||
 118375 ATGTTTCTACCTCTTCCCAGGACAT