seq1 = pF1KE1591.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KE1591/gi568815581f_40231219.tfa (gi568815581f:40231219_40456223), 225005 bp

>pF1KE1591 1386
>gi568815581f:40231219_40456223 (Chr17)

1-178  (100001-100178)   100% ->
179-327  (117098-117246)   100% ->
328-469  (118566-118707)   100% ->
470-630  (120692-120852)   100% ->
631-807  (121113-121289)   100% ->
808-1012  (123084-123288)   100% ->
1013-1171  (124045-124203)   100% ->
1172-1386  (124791-125005)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGCCTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGCCTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCA         CCATTGAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100151 AGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCAGTA...TAGCCATTGAGACCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117111 GAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117161 TACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAG         GGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 117211 TACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGTG...CAGGGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118571 CTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118621 AGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGT         CTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118671 CTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTGTG...CAGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120696 GAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120746 CTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120796 CGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACTACG         AACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120846 CACTACGGTA...CAGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121147 TTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121197 ACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 121247 CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGGTG...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808   ATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123082 AGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123132 TTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123182 CGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123232 TGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGCGGAG         ACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123282 TGCGGAGGTG...CAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124079 CATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124129 GGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGG         GGGCTGAGCGGGTGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124179 GACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGTG...CAGGGGCTGAGCGGGTGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124807 CACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124857 TGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124907 GGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1338 CAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124957 CAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG