seq1 = pF1KE1587.tfa, 282 bp
seq2 = pF1KE1587/gi568815582f_57313933.tfa (gi568815582f:57313933_57515858), 201926 bp

>pF1KE1587 282
>gi568815582f:57313933_57515858 (Chr16)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-188  (101149-101266)   100% ->
189-282  (101833-101926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCACTGAAGATGCTGGCCCTGGTCACCCTCCTCCTGGGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCACTGAAGATGCTGGCCCTGGTCACCCTCCTCCTGGGGGCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCAGCACATCCACGCAG         CTCGAGGGACCAATGTGGGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 TCTGCAGCACATCCACGCAGGTG...CAGCTCGAGGGACCAATGTGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGAGTGCTGCCTGGAGTACTTCAAGGGAGCCATTCCCCTTAGAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101170 GGGAGTGCTGCCTGGAGTACTTCAAGGGAGCCATTCCCCTTAGAAAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGACGTGGTACCAGACATCTGAGGACTGCTCCAGGGATGCCATCGT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101220 AAGACGTGGTACCAGACATCTGAGGACTGCTCCAGGGATGCCATCGTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       TTTTGTAACTGTGCAGGGCAGGGCCATCTGTTCGGACCCCAACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101270 ...TAGTTTTGTAACTGTGCAGGGCAGGGCCATCTGTTCGGACCCCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAAGAGAGTGAAGAATGCAGTTAAATACCTGCAAAGCCTTGAGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 ACAAGAGAGTGAAGAATGCAGTTAAATACCTGCAAAGCCTTGAGAGGTCT