seq1 = pF1KE1576.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KE1576/gi568815576f_22144814.tfa (gi568815576f:22144814_22345334), 200521 bp

>pF1KE1576 435
>gi568815576f:22144814_22345334 (Chr22)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-435  (100133-100521)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTGGGCTCCTGTCCTGCTCATGCTGTTTGTCTACTGCACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGTCCTGGGCTCCTGTCCTGCTCATGCTGTTTGTCTACTGCACAGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      GTTGTGGTCCTCAGCCGGTGCTGCATCAGCCGCCGGCCATGTCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGGTTGTGGTCCTCAGCCGGTGCTGCATCAGCCGCCGGCCATGTCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGCCCTTGGAACCACAATCCGCCTCACCTGCACCCTGAGGAACGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100178 CGGCCCTTGGAACCACAATCCGCCTCACCTGCACCCTGAGGAACGACCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACATCGGTGTGTACAGCGTCTACTGGTACCAGCAGAGGCCGGGCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100228 GACATCGGTGTGTACAGCGTCTACTGGTACCAGCAGAGGCCGGGCCACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCCAGGTTCCTGCTGAGATATTTCTCACAATCAGACAAGAGCCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100278 TCCCAGGTTCCTGCTGAGATATTTCTCACAATCAGACAAGAGCCAGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCAGGTCCCCCCTCGCTTCTCTGGATCCAAAGATGTGGCCAGGAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100328 CCCAGGTCCCCCCTCGCTTCTCTGGATCCAAAGATGTGGCCAGGAACAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGTATTTGAGCATCTCTGAGCTGCAGCCTGAGGACGAGGCTATGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100378 GGGTATTTGAGCATCTCTGAGCTGCAGCCTGAGGACGAGGCTATGTATTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGTGCTATGGGGGCCCGCAGCTCGGAGAAGGAGGAGAGGGAGAGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100428 CTGTGCTATGGGGGCCCGCAGCTCGGAGAAGGAGGAGAGGGAGAGGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGGAGGAAGAAATGGAACCCACTGCAGCCAGGACACGTGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100478 GGGAGGAAGAAATGGAACCCACTGCAGCCAGGACACGTGTCCCT