seq1 = pF1KE1572.tfa, 2580 bp
seq2 = pF1KE1572/gi568815596r_105167386.tfa (gi568815596r:105167386_105408301), 240916 bp

>pF1KE1572 2580
>gi568815596r:105167386_105408301 (Chr2)

(complement)

1-688  (100001-100688)   99% ->
689-883  (109597-109791)   99% ->
884-1038  (111792-111946)   100% ->
1039-1121  (123904-123986)   100% ->
1122-1463  (127579-127920)   100% ->
1464-1521  (130631-130688)   100% ->
1522-1665  (132599-132742)   100% ->
1666-1812  (134612-134758)   100% ->
1813-1972  (135288-135447)   100% ->
1973-2406  (138597-139030)   100% ->
2407-2580  (140743-140916)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTTGTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGTCAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGTCAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGGACCTCTACGTGGGCACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGAGGAGAGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGCTGCAGAGACACTTGGGCTTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100201 ACAGCTGCAGAGACACTTGGGCTTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCCTCAGCACTCAACAGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCATCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCGCATCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGGGCAGCCACGTTTGCACTGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGGGCAGCCACGTTTGCACTGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTGTGTAGAAGTTTGCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATCCAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTGTCGACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGAGCAGCCCCTCGCTGTGGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGAGCAGCCCCTCGCTGTGGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCTCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGACCACTCAGTACATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCTCCCAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCAAGAGGATAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGACAGGAGTTCCTGCTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100651 GAGACAGGAGTTCCTGCTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGTG...TAGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 109600 TGTTTGCCACAGTCGCAGGGATATCCCAGCGCGCCCCCGTGCACTGGTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109650 GAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCTCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGACGAATTCATCACAGTCCACAGCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109700 TGACGAATTCATCACAGTCCACAGCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109750 CGCTGCCCTTTAAGGAGGGCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGTA...CA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    884  GAAGAGTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111791 GGAAGAGTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCTAGCAAGCCGCAGAGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111841 ACCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCTAGCAAGCCGCAGAGTAGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111891 AGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TTTCAG         GTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111941 TTTCAGGTT...CAGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAAGAGCTCTTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123939 TATACAGTTTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAAGAGCTCTTCAGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1122        AAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123989 A...CAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTCTACCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTCCTGTTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127622 TTCCTGTTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127672 TGAGTACGCAGACCTGAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGAAGATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127722 CCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCCGCAGCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GAGGTAGCAAATGGCTACAAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127772 GAGGTAGCAAATGGCTACAAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGTCACTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127822 GTATGCAGAGGCTGACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGTCACTGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 127872 ACTTCTGTCTTCTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGAAGCACAAAAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1464         GTATTTTGCACTTGGACTGCTCTATCATTATAATAACCAAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127922 TG...CAGGTATTTTGCACTTGGACTGCTCTATCATTATAATAACCAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TGCTGCTGCAGTTCAG         TTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 130673 TGCTGCTGCAGTTCAGGTG...CAGTTGTGGGTGAACATTGTGAATGGCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ATGTCCAGGACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132624 ATGTCCAGGACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTGGGCCTATGCTGATTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132674 CTTACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTGGGCCTATGCTGATTGGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CCTGCAGAAAAGTGAAGAG         GTCGGAGTTCAGGTTTTCACCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 132724 CCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTT...CAGGTCGGAGTTCAGGTTTTCACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGAGACCTTTGGATGAACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134634 AGAGACCTTTGGATGAACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 ATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAGTATCTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134684 ATCAATTGCCTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAGTATCTGGAACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAG         AAAGAAGAGTATCACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 134734 TCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGGTG...CAGAAAGAAGAGTATCACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CCCACTTAGCTGTGCTGTACCTGGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135304 CCCACTTAGCTGTGCTGTACCTGGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135354 GCCAGTGGCAAGGGTGCAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGCGGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 135404 GCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTCGGTG...

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1973    AGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCCATGGAGAGCGCCATCCTGCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138594 CAGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCCATGGAGAGCGCCATCCTGCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138644 GGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 GCAGGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138694 GCAGGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 GAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCTTTCACACGCTGCTGGCCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138744 GAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCTTTCACACGCTGCTGGCCATCTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 CTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138794 CTGCATGCTGGCCCCACTGCCCACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 GCTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138844 GCTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATGCAGCCCAGGTGCTGCAGATGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 TGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCTCCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138894 TGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCTCCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 ATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138944 ATGAGGGACAGCATCCATGCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 GGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAG         ATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 138994 GGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGGTA...CAGATGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 AGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGACAAAAAGCTTTGTCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140747 AGTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGACAAAAAGCTTTGTCAGATA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 TGCCAAAATCCCTTTTGTGAGCCTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140797 TGCCAAAATCCCTTTTGTGAGCCTGTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 TCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140847 TCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCAT

   2650     .    :    .    :
   2561 CCAGTCCTGGCACTCGGACT
        ||||||||||||||||||||
 140897 CCAGTCCTGGCACTCGGACT