seq1 = pF1KE1568.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE1568/gi568815578r_44843112.tfa (gi568815578r:44843112_45060333), 217222 bp

>pF1KE1568 927
>gi568815578r:44843112_45060333 (Chr20)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-227  (103849-103948)   100% ->
228-380  (105114-105266)   100% ->
381-550  (108332-108501)   100% ->
551-698  (111457-111604)   100% ->
699-825  (116755-116881)   100% ->
826-927  (117121-117222)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCAAATTCCCAGACTCTGTGGAGGAGCTCCGCGCCGCCGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCCAAATTCCCAGACTCTGTGGAGGAGCTCCGCGCCGCCGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGAGTTTCCGCAACGGCCAGTACGCCGAGGCCTCCGCGCTCTACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGAGTTTCCGCAACGGCCAGTACGCCGAGGCCTCCGCGCTCTACGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGCTGCGGGTGCTGCAGGCGCAAG         GTTCTTCAGACCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 GCGCGCTGCGGGTGCTGCAGGCGCAAGGTA...CAGGTTCTTCAGACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAAGAAAGTGTTCTCTACTCCAACCGAGCAGCATGTCACTTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 GAAGAAGAAAGTGTTCTCTACTCCAACCGAGCAGCATGTCACTTGAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGAAACTGCAGAGACTGCATCAAAGATTGCACTTC         AGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103913 TGGAAACTGCAGAGACTGCATCAAAGATTGCACTTCGTA...TAGAGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCCTTGGTTCCCTTCAGCATTAAGCCCCTGCTGCGGCGAGCATCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105119 TGGCCTTGGTTCCCTTCAGCATTAAGCCCCTGCTGCGGCGAGCATCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGAGGCTCTGGAGAAGTACCCTATGGCCTATGTTGACTATAAGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105169 TATGAGGCTCTGGAGAAGTACCCTATGGCCTATGTTGACTATAAGACTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGCAGATTGATGATAATGTGACGTCAGCCGTAGAAGGCATCAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105219 GCTGCAGATTGATGATAATGTGACGTCAGCCGTAGAAGGCATCAACAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        AATGACCAGAGCTCTCATGGACTCGCTTGGGCCTGAGTGGCGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105269 G...CAGAATGACCAGAGCTCTCATGGACTCGCTTGGGCCTGAGTGGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGAAGCTGCCCTCAATCCCCTTGGTGCCTGTTTCAGCTCAGAAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108375 CTGAAGCTGCCCTCAATCCCCTTGGTGCCTGTTTCAGCTCAGAAGAGGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAATTCCTTGCCTTCGGAGAACCACAAAGAGATGGCTAAAAGCAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108425 GAATTCCTTGCCTTCGGAGAACCACAAAGAGATGGCTAAAAGCAAATCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGAAACCACAGCTACAAAGAACAGAG         TGCCTTCTGCTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108475 AAGAAACCACAGCTACAAAGAACAGAGGTG...TAGTGCCTTCTGCTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGTGGAGAAAGCCAGAGTTCTGAAGGAAGAAGGCAATGAGCTTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111471 GATGTGGAGAAAGCCAGAGTTCTGAAGGAAGAAGGCAATGAGCTTGTAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAGGGAAACCATAAGAAAGCTATTGAGAAGTACAGTGAAAGCCTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111521 GAAGGGAAACCATAAGAAAGCTATTGAGAAGTACAGTGAAAGCCTCTTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTAGTAACCTGGAATCTGCCACGTACAGCAACAG         AGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111571 GTAGTAACCTGGAATCTGCCACGTACAGCAACAGGTA...CAGAGCACTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGCTATTTGGTCCTGAAGCAGTACACAGAAGCAGTGAAGGACTGCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116762 TGCTATTTGGTCCTGAAGCAGTACACAGAAGCAGTGAAGGACTGCACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCCCTCAAGCTGGATGGAAAGAACGTGAAGGCATTCTACAGACGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116812 AGCCCTCAAGCTGGATGGAAAGAACGTGAAGGCATTCTACAGACGGGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGCCCACAAAGCACTCAAG         GACTATAAATCCAGCTTTGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116862 AAGCCCACAAAGCACTCAAGGTA...TAGGACTATAAATCCAGCTTTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACATCAGCAACCTCCTACAGATTGAGCCTAGGAATGGTCCTGCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117142 GACATCAGCAACCTCCTACAGATTGAGCCTAGGAATGGTCCTGCACAGAA

    950     .    :    .    :    .    :
    897 GTTGCGGCAGGAAGTGAAGCAGAACCTACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 117192 GTTGCGGCAGGAAGTGAAGCAGAACCTACAC