seq1 = pF1KE1567.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KE1567/gi568815585r_19073866.tfa (gi568815585r:19073866_19279564), 205699 bp

>pF1KE1567 1254
>gi568815585r:19073866_19279564 (Chr13)

(complement)

1-226  (100000-100224)   99% ->
227-375  (101171-101319)   100% ->
376-1056  (101958-102638)   100% ->
1057-1173  (105406-105522)   100% ->
1174-1254  (105619-105699)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGG
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATGCCTGCTGGGAACTGTACTGCCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CAATGCCTGCTGGGAACTGTACTGCCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 GTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 ACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGGACCTGGAGCCCACTGTGGTCG         ATGAAGTGCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100199 TGTGGACCTGGAGCCCACTGTGGTCGGTA...TAGATGAAGTGCGCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 GAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGCGGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101236 GATGCGGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCAAACTG         GCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101286 CGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCAAACTGGTA...CAGGCGGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101965 TGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTGGCTCTGGGTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102015 ACTGGCTCTGGGTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCCAGCCCCCCAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 CGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCCAGCCCCCCAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 CCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGAACATTCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 CTGGAACATTCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCCACGTACACCAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 CATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCCACGTACACCAACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 ATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACGGGGCCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 GACGGGGCCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCTACGCCCCGGTCATCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102365 GTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCTACGCCCCGGTCATCTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102415 CCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGCTTCGAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 TGCTTCGAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGGGGATGTGGTCCCGAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102515 GTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGGGGATGTGGTCCCGAAAGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102565 TCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GATTGGTGCCCAACTGGATTTAAG         GTGGGCATTAACTACCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102615 GATTGGTGCCCAACTGGATTTAAGGTA...CAGGTGGGCATTAACTACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAGGTGCAGCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105423 GCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAGGTGCAGCGGGCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105473 TGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174          GACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105523 GAC...GAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGATTCCGTGGAAGCCGAGGCTGAAGAAGGTGAAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105660 GGATTCCGTGGAAGCCGAGGCTGAAGAAGGTGAAGAATAC