seq1 = pF1KE1565.tfa, 2196 bp
seq2 = pF1KE1565/gi568815592r_6045622.tfa (gi568815592r:6045622_6418664), 373043 bp

>pF1KE1565 2196
>gi568815592r:6045622_6418664 (Chr6)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-319  (113126-113314)   100% ->
320-571  (151856-152107)   100% ->
572-690  (167736-167854)   100% ->
691-798  (170246-170353)   100% ->
799-973  (193805-193979)   100% ->
974-1112  (196494-196632)   100% ->
1113-1216  (221339-221442)   100% ->
1217-1305  (222780-222868)   100% ->
1306-1459  (236524-236677)   100% ->
1460-1747  (243798-244085)   100% ->
1748-1908  (251047-251207)   100% ->
1909-2045  (266716-266852)   99% ->
2046-2196  (272893-273043)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGAAACTTCCAGGACCGCCTTTGGAGGCAGAAGAGCAGTTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGAAACTTCCAGGACCGCCTTTGGAGGCAGAAGAGCAGTTCCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATAACTCTAATGCAGCGGAAGATGACCTGCCCACAGTGGAGCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAATAACTCTAATGCAGCGGAAGATGACCTGCCCACAGTGGAGCTTCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGGTGCCCCGGGGCGTCAACCTGCAAG         AGTTTCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 GCGTGGTGCCCCGGGGCGTCAACCTGCAAGGTA...TAGAGTTTCTTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCACGAGCGTTCACCTGTTCAAGGAGAGATGGGACACTAACAAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113137 GTCACGAGCGTTCACCTGTTCAAGGAGAGATGGGACACTAACAAGGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCACCACACTGACAAGTATGAAAACAACAAGCTGATTGTCCGCAGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113187 CCACCACACTGACAAGTATGAAAACAACAAGCTGATTGTCCGCAGAGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCTTTCTATGTGCAGATTGACTTCAGTCGTCCATATGACCCCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113237 AGTCTTTCTATGTGCAGATTGACTTCAGTCGTCCATATGACCCCAGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATCTCTTCAGGGTGGAATACGTCATTG         GTCGCTACCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 113287 GATCTCTTCAGGGTGGAATACGTCATTGGTG...TAGGTCGCTACCCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGAACAAGGGAACCTACATCCCAGTGCCTATAGTCTCAGAGTTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151869 GGAGAACAAGGGAACCTACATCCCAGTGCCTATAGTCTCAGAGTTACAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGGAAAGTGGGGGGCCAAGATTGTCATGAGAGAGGACAGGTCTGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151919 GTGGAAAGTGGGGGGCCAAGATTGTCATGAGAGAGGACAGGTCTGTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGTCCATCCAGTCTTCCCCCAAATGTATTGTGGGGAAATTCCGCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151969 CTGTCCATCCAGTCTTCCCCCAAATGTATTGTGGGGAAATTCCGCATGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTTGCTGTCTGGACTCCCTATGGCGTACTTCGAACCAGTCGAAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152019 TGTTGCTGTCTGGACTCCCTATGGCGTACTTCGAACCAGTCGAAACCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAACAGACACGTACATTCTCTTCAATCCTTGGTGTGAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 152069 AAACAGACACGTACATTCTCTTCAATCCTTGGTGTGAAGGTA...CAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATGCTGTGTATCTGGACAATGAGAAAGAAAGAGAAGAGTATGTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167738 GATGCTGTGTATCTGGACAATGAGAAAGAAAGAGAAGAGTATGTCCTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGACATCGGGGTAATTTTTTATGGAGAGGTCAATGACATCAAGACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167788 TGACATCGGGGTAATTTTTTATGGAGAGGTCAATGACATCAAGACCAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCTGGAGCTATGGTCAG         TTTGAAGATGGCATCCTGGACACT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 167838 GCTGGAGCTATGGTCAGGTG...TAGTTTGAAGATGGCATCCTGGACACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGCCTGTATGTGATGGACAGAGCACAAATGGACCTCTCTGGAAGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170270 TGCCTGTATGTGATGGACAGAGCACAAATGGACCTCTCTGGAAGAGGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCCATCAAAGTCAGCCGTGTGGGGTCTGCAATG         GTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 170320 TCCCATCAAAGTCAGCCGTGTGGGGTCTGCAATGGTA...TAGGTGAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCAAAGATGACGAAGGTGTCCTCGTTGGATCCTGGGACAATATCTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193812 CCAAAGATGACGAAGGTGTCCTCGTTGGATCCTGGGACAATATCTATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TATGGCGTCCCCCCATCGGCCTGGACTGGAAGCGTTGACATTCTATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193862 TATGGCGTCCCCCCATCGGCCTGGACTGGAAGCGTTGACATTCTATTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ATACCGGAGCTCTGAGAATCCAGTCCGGTATGGCCAATGCTGGGTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193912 ATACCGGAGCTCTGAGAATCCAGTCCGGTATGGCCAATGCTGGGTTTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGGTGTCTTTAACACAT         TTTTACGATGCCTTGGAATACCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 193962 CTGGTGTCTTTAACACATGTA...TAGTTTTACGATGCCTTGGAATACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCAAGAATTGTTACCAATTATTTCTCTGCCCATGATAATGATGCCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196517 GCAAGAATTGTTACCAATTATTTCTCTGCCCATGATAATGATGCCAATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAAATGGACATCTTCCTGGAAGAAGATGGGAACGTGAATTCCAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196567 GCAAATGGACATCTTCCTGGAAGAAGATGGGAACGTGAATTCCAAACTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAAGGATTCAGTGTG         GAACTACCACTGCTGGAATGAAGCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 196617 CCAAGGATTCAGTGTGGTG...AAGGAACTACCACTGCTGGAATGAAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TGGATGACAAGGCCTGACCTTCCTGTTGGATTTGGAGGCTGGCAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221364 TGGATGACAAGGCCTGACCTTCCTGTTGGATTTGGAGGCTGGCAAGCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGACAGCACCCCCCAGGAAAATAGCGATG         GCATGTATCGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 221414 GGACAGCACCCCCCAGGAAAATAGCGATGGTA...CAGGCATGTATCGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTGGCCCCGCCTCGGTTCAAGCCATCAAGCACGGCCATGTCTGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222792 GTGGCCCCGCCTCGGTTCAAGCCATCAAGCACGGCCATGTCTGCTTCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTTGATGCACCTTTTGTTTTTGCAGAG         GTCAACAGCGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 222842 TTTGATGCACCTTTTGTTTTTGCAGAGGTA...CAGGTCAACAGCGACCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CATTTACATTACAGCTAAGAAAGATGGCACTCATGTGGTGGAAAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236538 CATTTACATTACAGCTAAGAAAGATGGCACTCATGTGGTGGAAAATGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ATGCCACCCACATTGGGAAATTAATTGTGACCAAACAAATTGGAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236588 ATGCCACCCACATTGGGAAATTAATTGTGACCAAACAAATTGGAGGAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGCATGATGGATATTACTGATACTTACAAATTCCAAGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 236638 GGCATGATGGATATTACTGATACTTACAAATTCCAAGAAGGTA...CAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TCAAGAAGAAGAGAGATTGGCCCTAGAAACTGCCCTGATGTACGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243799 TCAAGAAGAAGAGAGATTGGCCCTAGAAACTGCCCTGATGTACGGAGCTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AAAAGCCCCTCAACACAGAAGGTGTCATGAAATCAAGGTCCAACGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243849 AAAAGCCCCTCAACACAGAAGGTGTCATGAAATCAAGGTCCAACGTTGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATGGACTTTGAAGTGGAAAATGCTGTGCTGGGAAAAGACTTCAAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243899 ATGGACTTTGAAGTGGAAAATGCTGTGCTGGGAAAAGACTTCAAGCTCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CATCACCTTCCGGAACAACAGCCACAACCGTTACACCATCACAGCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243949 CATCACCTTCCGGAACAACAGCCACAACCGTTACACCATCACAGCTTATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCTCAGCCAACATCACCTTCTACACCGGGGTCCCGAAGGCAGAATTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243999 TCTCAGCCAACATCACCTTCTACACCGGGGTCCCGAAGGCAGAATTCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AAGGAGACGTTCGACGTGACGCTGGAGCCCTTGTCCT         TCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 244049 AAGGAGACGTTCGACGTGACGCTGGAGCCCTTGTCCTGTA...TAGTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GAAAGAGGCGGTGCTGATCCAAGCCGGCGAGTACATGGGTCAGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251051 GAAAGAGGCGGTGCTGATCCAAGCCGGCGAGTACATGGGTCAGCTGCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 AACAAGCGTCCCTGCACTTCTTTGTCACAGCTCGCATCAATGAGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251101 AACAAGCGTCCCTGCACTTCTTTGTCACAGCTCGCATCAATGAGACCAGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GATGTTCTGGCCAAGCAAAAGTCCACCGTGCTAACCATCCCTGAGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251151 GATGTTCTGGCCAAGCAAAAGTCCACCGTGCTAACCATCCCTGAGATCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CATCAAG         GTCCGTGGCACTCAGGTAGTTGGTTCTGACATGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251201 CATCAAGGTC...TAGGTCCGTGGCACTCAGGTAGTTGGTTCTGACATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGTGATAGTTGAGTTTACCAATCCTTTAAAAGAAACCCTGCGAAATGTC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266750 CTGTGACAGTTGAGTTTACCAATCCTTTAAAAGAAACCCTGCGAAATGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TGGGTACACCTGGATGGTCCTGGAGTAACAAGACCAATGAAGAAGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266800 TGGGTACACCTGGATGGTCCTGGAGTAACAAGACCAATGAAGAAGATGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CCG         TGAAATCCGGCCCAACTCCACCGTGCAGTGGGAAGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266850 CCGGTA...CAGTGAAATCCGGCCCAACTCCACCGTGCAGTGGGAAGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TGTGCCGGCCCTGGGTCTCTGGGCATCGGAAGCTGATAGCCAGCATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272931 TGTGCCGGCCCTGGGTCTCTGGGCATCGGAAGCTGATAGCCAGCATGAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AGTGACTCCCTGAGACATGTGTATGGCGAGCTGGACGTGCAGATTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272981 AGTGACTCCCTGAGACATGTGTATGGCGAGCTGGACGTGCAGATTCAAAG

   2300     .    :
   2184 ACGACCTTCCATG
        |||||||||||||
 273031 ACGACCTTCCATG