seq1 = pF1KE1555.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KE1555/gi568815596r_109985698.tfa (gi568815596r:109985698_110215792), 230095 bp

>pF1KE1555 459
>gi568815596r:109985698_110215792 (Chr2)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-273  (124023-124190)   100% ->
274-399  (128096-128221)   100% ->
400-459  (130036-130095)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCGCCCGACCCGCCCGCCACCAGCTACGCCCCGTCCGACGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCGCCCGACCCGCCCGCCACCAGCTACGCCCCGTCCGACGTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGGGGTCGCGCTGTTCCTCACCATCCCTTTCGCCTTCTTCCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGGGGTCGCGCTGTTCCTCACCATCCCTTTCGCCTTCTTCCTGCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTG         ATATTTGGGTTCTTGGTCTGGACCATGGTAGCCGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGGTG...CAGATATTTGGGTTCTTGGTCTGGACCATGGTAGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCACATAGTATACCCCTTGCTGCAAGGATGGGTGATGTATGTCTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124059 ACCCACATAGTATACCCCTTGCTGCAAGGATGGGTGATGTATGTCTCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCTCGTTTCTCATCTCCTTGATGTTCCTGTTGTCTTACTTGTTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124109 CACCTCGTTTCTCATCTCCTTGATGTTCCTGTTGTCTTACTTGTTTGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTACAAAAGATTTGAATCCTGGAGAGTTCTG         GACAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 124159 TTTACAAAAGATTTGAATCCTGGAGAGTTCTGGTA...CAGGACAGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACCACGGGACCACTGGCATCCTGTACATGAGCGCTGCCGTCCTACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128105 TACCACGGGACCACTGGCATCCTGTACATGAGCGCTGCCGTCCTACAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACATGCCACGATTGTTTCTGAGAAACTGCTGGACCCAAGAATTTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128155 ACATGCCACGATTGTTTCTGAGAAACTGCTGGACCCAAGAATTTACTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTAATTCGGCAGCCTCG         TTCTTCGCCTTCATCGCCACGCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 128205 TTAATTCGGCAGCCTCGGTG...CAGTTCTTCGCCTTCATCGCCACGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 CTCTACATTCTCCATGCCTTCAGCATCTATTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130060 CTCTACATTCTCCATGCCTTCAGCATCTATTACCAC