seq1 = pF1KE1540.tfa, 375 bp
seq2 = pF1KE1540/gi568815579f_32481262.tfa (gi568815579f:32481262_32687297), 206036 bp

>pF1KE1540 375
>gi568815579f:32481262_32687297 (Chr19)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-104  (100934-100971)   100% ->
105-166  (103689-103750)   100% ->
167-258  (104555-104646)   100% ->
259-330  (105597-105668)   100% ->
331-375  (105992-106036)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGAGGAGCTTGAGGCGCTGAGGAGACAGAGGCTGGCCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGAGGAGCTTGAGGCGCTGAGGAGACAGAGGCTGGCCGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGCCAAACACGGG         GATCCTGGTGATGCGGCCCAACAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGGCCAAACACGGGGTG...CAGGATCCTGGTGATGCGGCCCAACAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGCAAAGCACAG         GGAAGCAGAAATGAGAAACAGTATCTTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100959 AAGCAAAGCACAGGTA...TAGGGAAGCAGAAATGAGAAACAGTATCTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCCCAAGTTCTGGATCAGTCGGCCCGGGCCAGGT         TAAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103717 GCCCAAGTTCTGGATCAGTCGGCCCGGGCCAGGTGTA...TAGTAAGTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CTTAGCACTTGTAAAGCCTGAAAAAACTAAAGCAGTAGAGAATTACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104562 CTTAGCACTTGTAAAGCCTGAAAAAACTAAAGCAGTAGAGAATTACCTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TACAGATGGCAAGATATGGACAACTAAGTGAGAAG         GTATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104612 TACAGATGGCAAGATATGGACAACTAAGTGAGAAGGTA...TAGGTATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GAACAAGGTTTAATAGAAATCCTTAAAAAAGTAAGCCAACAAACAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105603 GAACAAGGTTTAATAGAAATCCTTAAAAAAGTAAGCCAACAAACAGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GACAACAACAGTGAAA         TTCAACAGAAGAAAAGTAATGGACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105653 GACAACAACAGTGAAAGTA...CAGTTCAACAGAAGAAAAGTAATGGACT

    400     .    :    .    :
    356 CTGATGAAGATGACGATTAT
        ||||||||||||||||||||
 106017 CTGATGAAGATGACGATTAT