seq1 = pF1KE1534.tfa, 282 bp
seq2 = pF1KE1534/gi568815594r_75935047.tfa (gi568815594r:75935047_76135987), 200941 bp

>pF1KE1534 282
>gi568815594r:75935047_76135987 (Chr4)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-188  (100646-100772)   100% ->
189-261  (100869-100941)   100% ->
262-282  (101172-101192)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGTGAAGGGCATGGCTATAGCCTTGGCTGTGATATTGTGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGTGAAGGGCATGGCTATAGCCTTGGCTGTGATATTGTGTGCTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTTGTTCAAG         GCTTCCCCATGTTCAAAAGAGGACGCTGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTTGTTCAAGGTA...TAGGCTTCCCCATGTTCAAAAGAGGACGCTGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTGCATAGGCCCTGGGGTAAAAGCAGTGAAAGTGGCAGATATTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100676 TTTGCATAGGCCCTGGGGTAAAAGCAGTGAAAGTGGCAGATATTGAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTCCATAATGTACCCAAGTAACAACTGTGACAAAATAGAAGTGAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100726 GCCTCCATAATGTACCCAAGTAACAACTGTGACAAAATAGAAGTGATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       TATTACCCTGAAAGAAAATAAAGGACAACGATGCCTAAATCCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100776 ...CAGTATTACCCTGAAAGAAAATAAAGGACAACGATGCCTAAATCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AATCGAAGCAAGCAAGGCTTATAATCAAA         AAAGTTGAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100913 AATCGAAGCAAGCAAGGCTTATAATCAAAGTA...CAGAAAGTTGAAAGA

    300     .
    274 AAGAATTTT
        |||||||||
 101184 AAGAATTTT