seq1 = pF1KE1520.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KE1520/gi568815590f_37930574.tfa (gi568815590f:37930574_38157264), 226691 bp

>pF1KE1520 354
>gi568815590f:37930574_38157264 (Chr8)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-325  (126508-126687)   100% ->
326-354  (129331-129359)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGGGGCAGCAGCTGCAGCCAGACCCCAAGCCGGGCCATCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGGGGGCAGCAGCTGCAGCCAGACCCCAAGCCGGGCCATCCCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTCGCCGGGTGGTGCTCGGCGACGGCGTGCAGCTCCCGCCCGGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTCGCCGGGTGGTGCTCGGCGACGGCGTGCAGCTCCCGCCCGGGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCACGACCCCCGGCGGCACGCTCTTCAGCACCACCCCGGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 ACAGCACGACCCCCGGCGGCACGCTCTTCAGCACCACCCCGGGAGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GTACCAGGATCATCTATGACCGGAAATTCCTGATGGAGTGTCGGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .TAGGTACCAGGATCATCTATGACCGGAAATTCCTGATGGAGTGTCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCACCTGTGACCAAAACACCCCCAAGGGATCTGCCCACCATTCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126554 CTCACCTGTGACCAAAACACCCCCAAGGGATCTGCCCACCATTCCGGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCAGCCCTTCCAGTGATGAGCCCCCCATGGAAGCCAGCCAGAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126604 TCACCAGCCCTTCCAGTGATGAGCCCCCCATGGAAGCCAGCCAGAGCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCGCAATAGCCCAGAAGATAAGCGGGCGGGCG         GTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 126654 CTGCGCAATAGCCCAGAAGATAAGCGGGCGGGCGGTG...CAGGTGAAGA

    350     .    :    .    :
    333 GTCACAGTTTGAGATGGACATT
        ||||||||||||||||||||||
 129338 GTCACAGTTTGAGATGGACATT