seq1 = pF1KE1505.tfa, 1488 bp
seq2 = pF1KE1505/gi568815590f_144404305.tfa (gi568815590f:144404305_144606997), 202693 bp

>pF1KE1505 1488
>gi568815590f:144404305_144606997 (Chr8)

1-162  (100001-100162)   100% ->
163-252  (100300-100389)   100% ->
253-361  (100467-100575)   100% ->
362-495  (100694-100827)   100% ->
496-739  (100942-101185)   100% ->
740-819  (101544-101623)   100% ->
820-956  (101691-101827)   100% ->
957-1131  (101928-102102)   100% ->
1132-1287  (102197-102352)   100% ->
1288-1400  (102427-102539)   100% ->
1401-1488  (102606-102693)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCGAGCACAGGTGACCGGAGCCAGGCGGTGAGGCATGGACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCGAGCACAGGTGACCGGAGCCAGGCGGTGAGGCATGGACTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGAAGGTGCTGACGCTGGACGGCATGAACCCGCGTGTGCGGAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGAAGGTGCTGACGCTGGACGGCATGAACCCGCGTGTGCGGAGAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTACGCAGTGCGTGGCCCCATAGTGCAGCGAGCCTTGGAGCTGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTACGCAGTGCGTGGCCCCATAGTGCAGCGAGCCTTGGAGCTGGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCTGCGCCAG         GGTGTGAAGAAGCCTTTCACCGAGGTCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCTGCGCCAGGTA...CAGGGTGTGAAGAAGCCTTTCACCGAGGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGTGCCAACATCGGGGACGCACAGGCTATGGGGCAGAGGCCCATCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100329 CCGTGCCAACATCGGGGACGCACAGGCTATGGGGCAGAGGCCCATCACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTGCGCCAG         GTCTTGGCCCTCTGTGTTAACCCTGATCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100379 TCCTGCGCCAGGTG...CAGGTCTTGGCCCTCTGTGTTAACCCTGATCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGAGCAGCCCCAACTTCCCTGACGATGCCAAGAAAAGGGCGGAGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 CTGAGCAGCCCCAACTTCCCTGACGATGCCAAGAAAAGGGCGGAGCGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGCAGGCGTGTGGGGGCCACAGTCTGG         GGGCCTACAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100547 CTTGCAGGCGTGTGGGGGCCACAGTCTGGGTG...CAGGGGCCTACAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAGCTCCGGCATCCAGCTGATCCGGGAGGACGTGGCGCGGTACATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100706 TCAGCTCCGGCATCCAGCTGATCCGGGAGGACGTGGCGCGGTACATTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGGCGTGACGGAGGCATCCCTGCGGACCCCAACAACGTCTTCCTGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100756 AGGCGTGACGGAGGCATCCCTGCGGACCCCAACAACGTCTTCCTGTCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGGGCCAGCGATGCCATCGTG         ACGGTGCTGAAGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100806 AGGGGCCAGCGATGCCATCGTGGTA...CAGACGGTGCTGAAGCTGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCCGGCGAGGGCCACACACGCACGGGTGTGCTCATCCCCATCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100961 TGGCCGGCGAGGGCCACACACGCACGGGTGTGCTCATCCCCATCCCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCCACTCTACTCGGCCACGCTGGCAGAGCTGGGCGCAGTGCAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101011 TACCCACTCTACTCGGCCACGCTGGCAGAGCTGGGCGCAGTGCAGGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTACTACCTGGACGAGGAGCGTGCCTGGGCGCTGGACGTGGCCGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101061 TTACTACCTGGACGAGGAGCGTGCCTGGGCGCTGGACGTGGCCGAGCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCGTGCACTGGGCCAGGCGCGTGACCACTGCCGCCCTCGTGCGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101111 ACCGTGCACTGGGCCAGGCGCGTGACCACTGCCGCCCTCGTGCGCTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTCATCAACCCTGGCAACCCCACCG         GGCAGGTGCAGACCCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101161 GTCATCAACCCTGGCAACCCCACCGGTG...CAGGGCAGGTGCAGACCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGAGTGCATCGAGGCCGTGATCCGCTTCGCCTTCGAAGAGCGGCTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 CGAGTGCATCGAGGCCGTGATCCGCTTCGCCTTCGAAGAGCGGCTCTTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGCTGGCGGACGAG         GTGTACCAGGACAACGTGTACGCCGCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101610 TGCTGGCGGACGAGGTG...CAGGTGTACCAGGACAACGTGTACGCCGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGTTCGCAGTTCCACTCATTCAAGAAGGTGCTCATGGAGATGGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101718 GGTTCGCAGTTCCACTCATTCAAGAAGGTGCTCATGGAGATGGGGCCGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTACGCCGGGCAGCAGGAGCTTGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101768 CTACGCCGGGCAGCAGGAGCTTGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACATGGGCGA         GTGCGGGTTCCGCGGCGGCTATGTGGAGGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101818 ACATGGGCGAGTG...CAGGTGCGGGTTCCGCGGCGGCTATGTGGAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGAACATGGACGCTGCAGTGCAGCAGCAGATGCTGAAGCTGATGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101959 GTGAACATGGACGCTGCAGTGCAGCAGCAGATGCTGAAGCTGATGAGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCGGCTGTGCCCGCCGGTGCCAGGACAGGCCCTGCTGGACCTGGTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102009 GCGGCTGTGCCCGCCGGTGCCAGGACAGGCCCTGCTGGACCTGGTGGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCCCGCCCGCGCCCACCGACCCCTCCTTTGCGCAGTTCCAGGCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102059 GCCCGCCCGCGCCCACCGACCCCTCCTTTGCGCAGTTCCAGGCTGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132    GAGAAGCAGGCAGTGCTGGCAGAGCTGGCGGCCAAGGCCAAGCTCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102194 CAGGAGAAGCAGGCAGTGCTGGCAGAGCTGGCGGCCAAGGCCAAGCTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGAGCAGGTCTTCAATGAGGCTCCTGGCATCAGCTGCAACCCAGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102244 CGAGCAGGTCTTCAATGAGGCTCCTGGCATCAGCTGCAACCCAGTGCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCGCCATGTACTCCTTCCCGCGCGTGCAGCTGCCCCCGCGGGCGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102294 GCGCCATGTACTCCTTCCCGCGCGTGCAGCTGCCCCCGCGGGCGGTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCGCTCAG         GAGCTGGGCCTGGCCCCCGATATGTTCTTCTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102344 CGCGCTCAGGTC...CAGGAGCTGGGCCTGGCCCCCGATATGTTCTTCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCTGCGCCTCCTGGAGGAGACCGGCATCTGCGTGGTGCCAGGGAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102459 CCTGCGCCTCCTGGAGGAGACCGGCATCTGCGTGGTGCCAGGGAGCGGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TTGGGCAGCGGGAAGGCACCTACCACTTCCG         GATGACCATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102509 TTGGGCAGCGGGAAGGCACCTACCACTTCCGGTG...CAGGATGACCATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTGCCCCCCTTGGAGAAACTGCGGCTGCTGCTGGAGAAGCTGAGCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102616 CTGCCCCCCTTGGAGAAACTGCGGCTGCTGCTGGAGAAGCTGAGCAGGTT

   1550     .    :    .    :    .
   1461 CCATGCCAAGTTCACCCTCGAGTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 102666 CCATGCCAAGTTCACCCTCGAGTACTCC