seq1 = pF1KE1503.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KE1503/gi568815590r_144689807.tfa (gi568815590r:144689807_144892129), 202323 bp

>pF1KE1503 771
>gi568815590r:144689807_144892129 (Chr8)

(complement)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-280  (100216-100357)   100% ->
281-499  (100635-100853)   99% ->
500-615  (101660-101775)   100% ->
616-771  (102168-102323)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGTGTGATCCGTGGACAGAGGAAGGGCGCCGGGTCTGTGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGTGTGATCCGTGGACAGAGGAAGGGCGCCGGGTCTGTGTTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCACGTGAAGCACCGTAAAGGCGCTGCGCGCCTGCGCGCCGTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGCACGTGAAGCACCGTAAAGGCGCTGCGCGCCTGCGCGCCGTGGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCTGAGCGGCACGGCTACATCAAGGGCATCGTCAAG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 TCGCTGAGCGGCACGGCTACATCAAGGGCATCGTCAAGGTG...CAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCATCCACGACCCGGGCCGCGGCGCGCCCCTCGCCAAGGTGGTCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100219 ATCATCCACGACCCGGGCCGCGGCGCGCCCCTCGCCAAGGTGGTCTTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATCCGTATCGGTTTAAGAAGCGGACGGAGCTGTTCATTGCCGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100269 GGATCCGTATCGGTTTAAGAAGCGGACGGAGCTGTTCATTGCCGCCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCATTCACACGGGCCAGTTTGTGTATTGCGGCAAGAAGG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100319 GCATTCACACGGGCCAGTTTGTGTATTGCGGCAAGAAGGGTT...CAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCTCAACGTTGGCAATGTGCTCCCTGTGGGCACCATGCCTGAGGGTAC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100637 CAGCTCAACATTGGCAATGTGCTCCCTGTGGGCACCATGCCTGAGGGTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATCGTGTGCTGCCTGGAGGAGAAGCCTGGAGACCGTGGCAAGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100687 AATCGTGTGCTGCCTGGAGGAGAAGCCTGGAGACCGTGGCAAGCTGGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCATCAGGGAACTATGCCACCGTTATCTCCCACAACCCTGAGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100737 GGGCATCAGGGAACTATGCCACCGTTATCTCCCACAACCCTGAGACCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGACCCGTGTGAAGCTGCCCTCCGGCTCCAAGAAGGTTATCTCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100787 AAGACCCGTGTGAAGCTGCCCTCCGGCTCCAAGAAGGTTATCTCCTCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAACAGAGCTGTGGTTG         GTGTGGTGGCTGGAGGTGGCCGAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100837 CAACAGAGCTGTGGTTGGTG...CAGGTGTGGTGGCTGGAGGTGGCCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGACAAACCCATCTTGAAGGCTGGCCGGGCGTACCACAAATATAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101684 TTGACAAACCCATCTTGAAGGCTGGCCGGGCGTACCACAAATATAAGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGAGGAACTGCTGGCCACGAGTACGGGGTGTGGCCATGAAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101734 AAGAGGAACTGCTGGCCACGAGTACGGGGTGTGGCCATGAATGTA...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    616  CCTGTGGAGCATCCTTTTGGAGGTGGCAACCACCAGCACATCGGCAAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102167 GCCTGTGGAGCATCCTTTTGGAGGTGGCAACCACCAGCACATCGGCAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTCCACCATCCGCAGAGATGCCCCTGCTGGCCGCAAAGTGGGTCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102217 CCTCCACCATCCGCAGAGATGCCCCTGCTGGCCGCAAAGTGGGTCTCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTGCCCGCCGGACTGGACGTCTCCGGGGAACCAAGACTGTGCAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102267 GCTGCCCGCCGGACTGGACGTCTCCGGGGAACCAAGACTGTGCAGGAGAA

    800     .
    765 AGAGAAC
        |||||||
 102317 AGAGAAC