seq1 = pF1KE1495.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KE1495/gi568815576r_39125726.tfa (gi568815576r:39125726_39343963), 218238 bp

>pF1KE1495 723
>gi568815576r:39125726_39343963 (Chr22)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-160  (108090-108186)   100% ->
161-250  (110440-110529)   100% ->
251-456  (112137-112342)   100% ->
457-601  (113736-113880)   100% ->
602-723  (118117-118238)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCGCTGCTGGGCGCTCTTCCTGTCTCTCTGCTGCTACCTGCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCGCTGCTGGGCGCTCTTCCTGTCTCTCTGCTGCTACCTGCGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCAGCGCCGAG         GGGGACCCCATTCCCGAGGAGCTTTATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCAGCGCCGAGGTG...CAGGGGGACCCCATTCCCGAGGAGCTTTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATGCTGAGTGACCACTCGATCCGCTCCTTTGATGATCTCCAACGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108118 AGATGCTGAGTGACCACTCGATCCGCTCCTTTGATGATCTCCAACGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCACGGAGACCCCGGAG         AGGAAGATGGGGCCGAGTTGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108168 CTGCACGGAGACCCCGGAGGTA...CAGAGGAAGATGGGGCCGAGTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGAACATGACCCGCTCCCACTCTGGAGGCGAGCTGGAGAGCTTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110462 CCTGAACATGACCCGCTCCCACTCTGGAGGCGAGCTGGAGAGCTTGGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGGAAGAAGGAGCCTGG         GTTCCCTGACCATTGCTGAGCCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110512 GTGGAAGAAGGAGCCTGGGTA...CAGGTTCCCTGACCATTGCTGAGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCATGATCGCCGAGTGCAAGACGCGCACCGAGGTGTTCGAGATCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112160 GCCATGATCGCCGAGTGCAAGACGCGCACCGAGGTGTTCGAGATCTCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGCCTCATAGACCGCACCAACGCCAACTTCCTGGTGTGGCCGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112210 GCGCCTCATAGACCGCACCAACGCCAACTTCCTGGTGTGGCCGCCCTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGAGGTGCAGCGCTGCTCCGGCTGCTGCAACAACCGCAACGTGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112260 TGGAGGTGCAGCGCTGCTCCGGCTGCTGCAACAACCGCAACGTGCAGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCCCCACCCAGGTGCAGCTGCGACCTGTCCAG         GTGAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112310 CGCCCCACCCAGGTGCAGCTGCGACCTGTCCAGGTG...CAGGTGAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATCGAGATTGTGCGGAAGAAGCCAATCTTTAAGAAGGCCACGGTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113744 GATCGAGATTGTGCGGAAGAAGCCAATCTTTAAGAAGGCCACGGTGACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGAAGACCACCTGGCATGCAAGTGTGAGACAGTGGCAGCTGCACGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113794 TGGAAGACCACCTGGCATGCAAGTGTGAGACAGTGGCAGCTGCACGGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGACCCGAAGCCCGGGGGGTTCCCAGGAGCAGCGAG         CCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113844 GTGACCCGAAGCCCGGGGGGTTCCCAGGAGCAGCGAGGTA...CAGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AACGCCCCAAACTCGGGTGACCATTCGGACGGTGCGAGTCCGCCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118121 AACGCCCCAAACTCGGGTGACCATTCGGACGGTGCGAGTCCGCCGGCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCAAGGGCAAGCACCGGAAATTCAAGCACACGCATGACAAGACGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118171 CCAAGGGCAAGCACCGGAAATTCAAGCACACGCATGACAAGACGGCACTG

    750     .    :    .
    706 AAGGAGACCCTTGGAGCC
        ||||||||||||||||||
 118221 AAGGAGACCCTTGGAGCC