seq1 = pF1KE1494.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KE1494/gi568815584r_24531077.tfa (gi568815584r:24531077_24734160), 203084 bp

>pF1KE1494 741
>gi568815584r:24531077_24734160 (Chr14)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-203  (101099-101246)   99% ->
204-339  (101702-101837)   100% ->
340-600  (102043-102303)   100% ->
601-741  (102947-103087)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAACCAATCCTGCTTCTGCTGGCCTTCCTCCTGCTGCCCAGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAACCAATCCTGCTTCTGCTGGCCTTCCTCCTGCTGCCCAGGGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAG         GGGAGATCATCGGGGGACATGAGGCCAAGCCCCACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGGTG...CAGGGGAGATCATCGGGGGACATGAGGCCAAGCCCCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGCCCCTACATGGCTTATCTTATGATCTGGGATCAGAAGTCTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 CCCGCCCCTACATGGCTTATCTTATGATCTGGGATCAGAAGTCTCTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGTGCGGTGGCTTCCTGATACAAGACGACTTCGTGCTGACAGCTGCTCA
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 101185 AGGTGCGGTGGCTTCCTGATACGAGACGACTTCGTGCTGACAGCTGCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGTTGGGGAAG         CTCCATAAATGTCACCTTGGGGGCCCACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101235 CTGTTGGGGAAGGTG...CAGCTCCATAAATGTCACCTTGGGGGCCCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATATCAAAGAACAGGAGCCGACCCAGCAGTTTATCCCTGTGAAAAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101731 ATATCAAAGAACAGGAGCCGACCCAGCAGTTTATCCCTGTGAAAAGACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCCCCCATCCAGCCTATAATCCTAAGAACTTCTCCAACGACATCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101781 ATCCCCCATCCAGCCTATAATCCTAAGAACTTCTCCAACGACATCATGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGCAG         CTGGAGAGAAAGGCCAAGCGGACCAGAGCTGTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101831 ACTGCAGGTG...CAGCTGGAGAGAAAGGCCAAGCGGACCAGAGCTGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCCCTCAGGCTACCTAGCAACAAGGCCCAGGTGAAGCCAGGGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 AGCCCCTCAGGCTACCTAGCAACAAGGCCCAGGTGAAGCCAGGGCAGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGCAGTGTGGCCGGCTGGGGGCAGACGGCCCCCCTGGGAAAACACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102127 TGCAGTGTGGCCGGCTGGGGGCAGACGGCCCCCCTGGGAAAACACTCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACACTACAAGAGGTGAAGATGACAGTGCAGGAAGATCGAAAGTGCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102177 CACACTACAAGAGGTGAAGATGACAGTGCAGGAAGATCGAAAGTGCGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGACTTACGCCATTATTACGACAGTACCATTGAGTTGTGCGTGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102227 CTGACTTACGCCATTATTACGACAGTACCATTGAGTTGTGCGTGGGGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAGAGATTAAAAAGACTTCCTTTAAG         GGGGACTCTGGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102277 CCAGAGATTAAAAAGACTTCCTTTAAGGTA...CAGGGGGACTCTGGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCTCTTGTGTGTAACAAGGTGGCCCAGGGCATTGTCTCCTATGGACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102961 CCCTCTTGTGTGTAACAAGGTGGCCCAGGGCATTGTCTCCTATGGACGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAATGGCATGCCTCCACGAGCCTGCACCAAAGTCTCAAGCTTTGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103011 ACAATGGCATGCCTCCACGAGCCTGCACCAAAGTCTCAAGCTTTGTACAC

    750     .    :    .    :    .
    715 TGGATAAAGAAAACCATGAAACGCCAC
        |||||||||||||||||||||||| ||
 103061 TGGATAAAGAAAACCATGAAACGCTAC