seq1 = pF1KE1490.tfa, 2010 bp
seq2 = pF1KE1490/gi568815579r_8390594.tfa (gi568815579r:8390594_8599781), 209188 bp

>pF1KE1490 2010
>gi568815579r:8390594_8599781 (Chr19)

(complement)

1-32  (97191-97221)   93% ->
33-1432  (100007-101406)   99% ->
1433-1499  (101493-101559)   100% ->
1500-1576  (101942-102018)   100% ->
1577-1634  (108625-108682)   100% ->
1635-1743  (108787-108895)   100% ->
1744-1906  (109026-109188)   100% ->
1907-1940  (109273-109306)   100% ->
1941-1975  (109410-109444)   100% ->
1976-2010  (109556-109590)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCATCACCTGCCTGCAGCCATGGAGAA         CCATCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||| ||->>>...>>>|||||||||
  97191 ATGGCCCATCACCTGCCTGCAGCCATGGTGA GTG...GAGCCATCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTCCGGAGCATCAAAGCAAAGTTCCAGGCCTCTCAGCCGGAGCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 CTTCCGGAGCATCAAAGCAAAGTTCCAGGCCTCTCAGCCGGAGCCCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTGCCCAAAAAACCTCCGAAGCCTGAGTTTGGTAAACTGAAGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 ACCTGCCCAAAAAACCTCCGAAGCCTGAGTTTGGTAAACTGAAGAAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCAGCCTGAGCTAAGCGAGCACCCCAAGAAGGCCCCGCTGCCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100116 TCCCAGCCTGAGCTAAGCGAGCACCCCAAGAAGGCCCCGCTGCCTGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGTGCAGTGTCCTTGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGACCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100166 TGGTGCAGTGTCCTTGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGACCTCCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGACCTCCCCAAGAAGCCCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100216 AGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGACCTCCCCAAGAAGCCCCCGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGAGGTCACTGACCTCCCCAAGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100266 CCTGAGGTCACTGACCTCCCCAAGAAGCCCCCGCCGCCTGAGGTCACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCCCCAAGAAGCCGTCCAAACTGGAGTTGAGTGACCTCTCCAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100316 CCTCCCCAAGAAGCCGTCCAAACTGGAGTTGAGTGACCTCTCCAAGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCCACAGCTGGGGGCCACTCCGTTTCCAAGGAAGCCCCTGCAGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100366 TCCCACAGCTGGGGGCCACTCCGTTTCCAAGGAAGCCCCTGCAGCCTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTCGGTGAGGCCCCTTTGAAGGCCTCGCTGCCGGAGCCTGGTGCGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100416 GTCGGTGAGGCCCCTTTGAAGGCCTCGCTGCCGGAGCCTGGTGCGCCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCGGAAACCCCTGCAGCCCGACGAACTCAGTCACCCCGCCAGACCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100466 CCGGAAACCCCTGCAGCCCGACGAACTCAGTCACCCCGCCAGACCCCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCGAACCCAAATCCGGCGCATTCCCCAGGAAGCTCTGGCAACCCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100516 CCGAACCCAAATCCGGCGCATTCCCCAGGAAGCTCTGGCAACCCGAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGTGAGGCTACCCCGAGGTCCCCGCAGCCTGAGTTGAGTACCTTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100566 GGTGAGGCTACCCCGAGGTCCCCGCAGCCTGAGTTGAGTACCTTTCCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAGCCTGCGCAGCCTGAGTTCAACGTGTACCCCAAAAAGCCTCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100616 GAAGCCTGCGCAGCCTGAGTTCAACGTGTACCCCAAAAAGCCTCCGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCAGGTCGGTGGCCTCCCTAAGAAGTCCGTGCCGCAGCCTGAGTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100666 CTCAGGTCGGTGGCCTCCCTAAGAAGTCCGTGCCGCAGCCTGAGTTCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGGCCGCTCAGACTCCCCTCTGGAAGCCTCAGTCCAGCGAGCCGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100716 GAGGCCGCTCAGACTCCCCTCTGGAAGCCTCAGTCCAGCGAGCCGAAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGACTCCAGCGCCTTTCCCAAAAAGGCCTCCCAGCCTCCGCTGAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100766 CGACTCCAGCGCCTTTCCCAAAAAGGCCTCCCAGCCTCCGCTGAGTGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTCCCAAGAAGCCTCCGCAGCCTGAGCTTGGGGACCTCACCAGGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100816 TTCCCAAGAAGCCTCCGCAGCCTGAGCTTGGGGACCTCACCAGGACCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCAGAGCCCGAAGTCAGCGTGCTTCCCAAGAGGCCGCGGCCGGCCGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100866 TCAGAGCCCGAAGTCAGCGTGCTTCCCAAGAGGCCGCGGCCGGCCGAATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAAAGCGCTCTCCAAGAAGCCCCCGCAGCCCGAGCTGGGCGGCCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100916 CAAAGCGCTCTCCAAGAAGCCCCCGCAGCCCGAGCTGGGCGGCCTCCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGACCTCCTCAGAGCCCGAGTTCAACTCACTCCCCAGGAAGCTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100966 GGACCTCCTCAGAGCCCGAGTTCAACTCACTCCCCAGGAAGCTGCTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCGGAGCGCCGGGGGCCACCCCGCAAGTTCTCACAGCCTGAGCCCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101016 CCGGAGCGCCGGGGGCCACCCCGCAAGTTCTCACAGCCTGAGCCCAGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGTCCTCAAGAGACACCCGCAGCCTGAGTTCTTCGGTGATCTCCCTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101066 TGTCCTCAAGAGACACCCGCAGCCTGAGTTCTTCGGTGATCTCCCTCGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AGCCTCCACTCCCCAGCTCCGCTTCCGAGAGCTCACTGCCTGCGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101116 AGCCTCCACTCCCCAGCTCCGCTTCCGAGAGCTCACTGCCTGCGGCCGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GCCGGCTTCAGCTCCCGGCACCCGCTCAGCCCTGGGTTTGGAGCCGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 101166 GCCGGCTTCAGCTCCCGGCACCCGCTCAGCCCTGGGTTTGGAGCGGCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GACACCCCGCTGGAGGTCAGGAGGCCTGGTTCACAGTGGAGGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101216 GACACCCCGCTGGAGGTCAGGAGGCCTGGTTCACAGTGGAGGGGCCAGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CAGGCCTCAGACCCAGCCATCCACCCCGGCGGAGGCCTCTGCCCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101266 CAGGCCTCAGACCCAGCCATCCACCCCGGCGGAGGCCTCTGCCCCCTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGCAGCCTGGGACACCCTCCAGCCAAGCCCCCGCTGCCCCCGGGGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 AGCAGCCTGGGACACCCTCCAGCCAAGCCCCCGCTGCCCCCGGGGCCCGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GGATATGCAGAGCTTTCGGAGACCCTCTGCAGCATCCATAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101366 GGATATGCAGAGCTTTCGGAGACCCTCTGCAGCATCCATAGGTG...CAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ATCTACGGAGGACCCGCTCGGCCGCTGGGCTCCACTTCCAGGACCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101493 ATCTACGGAGGACCCGCTCGGCCGCTGGGCTCCACTTCCAGGACCGACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CCTGAAGACATCCCGCA         GGTCCCAGATGAGATCTACGAGCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101543 CCTGAAGACATCCCGCAGTG...CAGGGTCCCAGATGAGATCTACGAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GTATGACGATGTGGAACCCAGAGATGACTCCAGCCCCAGCCCCAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101966 GTATGACGATGTGGAACCCAGAGATGACTCCAGCCCCAGCCCCAAGGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GAG         ATGAAGCGCCCTCAGTTCAGCAAGCCGCCAGGAGGCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102016 GAGGTT...CAGATGAAGCGCCCTCAGTTCAGCAAGCCGCCAGGAGGCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CCACAAGACCCAGCGCTCAG         GAAGGAGAAGGATCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108663 CCACAAGACCCAGCGCTCAGGTG...CAGGAAGGAGAAGGATCCCCAGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 ACAGCAGTTGCCACCCATGGACCCAAAGTTGCTGAAGCAGCTGAGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108808 ACAGCAGTTGCCACCCATGGACCCAAAGTTGCTGAAGCAGCTGAGGAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CAGAGAAGGCCGAGAGGGAGTTCCGGAAGAAGTTCAAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 108858 CAGAGAAGGCCGAGAGGGAGTTCCGGAAGAAGTTCAAGGTG...CAGTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GAAGGGGAGATCGTGGTTCACACGAAGATGATGATCGACCCCAACGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109029 GAAGGGGAGATCGTGGTTCACACGAAGATGATGATCGACCCCAACGCTAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 GACACGTCGCGGGGGTGGCAAGCACCTCGGGATCCGGCGCGGGGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109079 GACACGTCGCGGGGGTGGCAAGCACCTCGGGATCCGGCGCGGGGAGATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 TGGAGGTGATCGAGTTCACCAGCAATGAGGAGATGCTGTGCCGGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109129 TGGAGGTGATCGAGTTCACCAGCAATGAGGAGATGCTGTGCCGGGACCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 AAAGGCAAAT         ATGGCTACGTGCCCAGAACAGCGCTCCTGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109179 AAAGGCAAATGTG...CAGATGGCTACGTGCCCAGAACAGCGCTCCTGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 CCT         GGAGACGGAGGTGTACGATGATGTCGACTTCTGCG   
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 109304 CCTGTG...CAGGGAGACGGAGGTGTACGATGATGTCGACTTCTGCGGTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :
   1976       ATCCCCTGGAAAACCAACCACTCCCCCTGGGACGG
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109448 ...CAGATCCCCTGGAAAACCAACCACTCCCCCTGGGACGG