seq1 = pF1KE1486.tfa, 2709 bp
seq2 = pF1KE1486/gi568815581f_57005465.tfa (gi568815581f:57005465_57220321), 214857 bp

>pF1KE1486 2709
>gi568815581f:57005465_57220321 (Chr17)

1-1714  (100001-101714)   100% ->
1715-1848  (104561-104694)   100% ->
1849-1975  (106334-106460)   100% ->
1976-2103  (107027-107154)   100% ->
2104-2281  (108995-109172)   100% ->
2282-2432  (110647-110797)   99% ->
2433-2500  (111396-111463)   100% ->
2501-2574  (112917-112990)   100% ->
2575-2637  (113518-113580)   100% ->
2638-2709  (114786-114857)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAATCCAGTTCCGTTCGCTCTTCCCCTTGGCATTGCCTGGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAATCCAGTTCCGTTCGCTCTTCCCCTTGGCATTGCCTGGGATGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCTCCTCGGCTGGTGGTGGTTTTTCTCTCGTAAAAAAGGCCATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCTCCTCGGCTGGTGGTGGTTTTTCTCTCGTAAAAAAGGCCATGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCCATGATGAGCAGCAGGTGGAGGCTGGTGCTGTGCAGCTGAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGCCATGATGAGCAGCAGGTGGAGGCTGGTGCTGTGCAGCTGAGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCTGCCATCAAGGAACCTCTCCCCGTGGAAGACGTCTGTCCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCTGCCATCAAGGAACCTCTCCCCGTGGAAGACGTCTGTCCCAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTGTCCACACCCCCCAGTGTCACAGAGCCTCCAGAAAAGGAACTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTGTCCACACCCCCCAGTGTCACAGAGCCTCCAGAAAAGGAACTGTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGTGAGCAAGCTGCCTGCAGAGCCCCCAGCATTGCTCCAGACACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGTGAGCAAGCTGCCTGCAGAGCCCCCAGCATTGCTCCAGACACACCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTGCCGAAGATCAGAGTCCTCGGGCATTCTTCCTAACACCACAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTTGCCGAAGATCAGAGTCCTCGGGCATTCTTCCTAACACCACAGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGATTGCGACCAGGAACACGCAGAGATGACAGTACAAAGCTGGAGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGATTGCGACCAGGAACACGCAGAGATGACAGTACAAAGCTGGAGCTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTGACAGGTGGTGAAGCCAAATCGATTCCTCTAGAGTGCCCCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCTGACAGGTGGTGAAGCCAAATCGATTCCTCTAGAGTGCCCCCTTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCCCAAAGGGTGTACTATTCTCCAGCAAATCAGCTGAGGTGTGTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCCCAAAGGGTGTACTATTCTCCAGCAAATCAGCTGAGGTGTGTAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGATTCCCCCTTCAGCAGGGTGCCAAGGAAGGTCCAGCCAGGCTACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGATTCCCCCTTCAGCAGGGTGCCAAGGAAGGTCCAGCCAGGCTACCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAGTCCCCGCAGAGAAGCGTAGCTCTGGGGAGAGGGCAAGAGAGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAGTCCCCGCAGAGAAGCGTAGCTCTGGGGAGAGGGCAAGAGAGACAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGGCCGAAGGGACTGGTGATGCCGTGTTGGGGGAAAAGGTGCTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGGCCGAAGGGACTGGTGATGCCGTGTTGGGGGAAAAGGTGCTTGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGCTCTGTTGTCTCGGGAGCATGTCTTGGAATTGGAGAACAGCAAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGCTCTGTTGTCTCGGGAGCATGTCTTGGAATTGGAGAACAGCAAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAGCCTGGCCTCTTTAGAGGGGGAAGAAGATAAGGGGAAGAGCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAGCCTGGCCTCTTTAGAGGGGGAAGAAGATAAGGGGAAGAGCAGCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCCAGGTGGTGGGGCCAGTGCAGGAGGAAGAGTATGTAGCAGAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCCAGGTGGTGGGGCCAGTGCAGGAGGAAGAGTATGTAGCAGAGAAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCAAGTAGGTTCATCGAGTCGGCTCACACAGAGCTGGCAAAGGACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCAAGTAGGTTCATCGAGTCGGCTCACACAGAGCTGGCAAAGGACGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGCGCCAGCACCCCCAGTCGCAGACGCCAAAGCCCAGGATAGAGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGGCGCCAGCACCCCCAGTCGCAGACGCCAAAGCCCAGGATAGAGGTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGGAGAACTGGGCAATGAGGAGAGCTTGGATAGAAATGAGGAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGGAGAACTGGGCAATGAGGAGAGCTTGGATAGAAATGAGGAGGGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGATAGAAATGAGGAGGGCTTGGATAGAAATGAGGAGAGCTTGGATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGATAGAAATGAGGAGGGCTTGGATAGAAATGAGGAGAGCTTGGATAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGAGGAGGGCTTGGATAGAAATGAGGAGATTAAGCGGGCTGCCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGAGGAGGGCTTGGATAGAAATGAGGAGATTAAGCGGGCTGCCTTCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATAATCTCCCAAGTGATCTCAGAAGCAACCGAACAGGTGCTGGCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATAATCTCCCAAGTGATCTCAGAAGCAACCGAACAGGTGCTGGCCACCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGTTGGCAAGGTTGCAGGTCGTGTGTGTCAGGCCAGTCAGCTCCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGTTGGCAAGGTTGCAGGTCGTGTGTGTCAGGCCAGTCAGCTCCAAGGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAAGGAAGAGAGCTGTGTCCCAGTTCACCAGAAAACTGTCTTGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAAGGAAGAGAGCTGTGTCCCAGTTCACCAGAAAACTGTCTTGGGCCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACACTGCGGAGCCTGCCACAGCAGAGGCAGCTGTTGCCCCGCCGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACACTGCGGAGCCTGCCACAGCAGAGGCAGCTGTTGCCCCGCCGGATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGCCTCCCCTTGCCAGGCCTACCAGCAGAGGGCTCACCACCACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGCCTCCCCTTGCCAGGCCTACCAGCAGAGGGCTCACCACCACCAAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCTACGTGAGCTGCCTGAAGAGCCTTCTGTCCAGCCCCACCAAGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCTACGTGAGCTGCCTGAAGAGCCTTCTGTCCAGCCCCACCAAGGACAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGCCAAATATCTCTGCACACCACATCTCCCTGGCCTCCTGCCTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGCCAAATATCTCTGCACACCACATCTCCCTGGCCTCCTGCCTGGCACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GACCACCCCCAGTGAAGAGTTGCCGGACCGGGCAGGCATCCTGGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GACCACCCCCAGTGAAGAGTTGCCGGACCGGGCAGGCATCCTGGTGGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ATGCCACCTGTGTCACCTGCATGTCAGACAGCAGCCAAAGTGTCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ATGCCACCTGTGTCACCTGCATGTCAGACAGCAGCCAAAGTGTCCCTTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GTGGCTTCTCCAGGACACTGCTCAGATTCTTTCAGCACTTCAGGGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GTGGCTTCTCCAGGACACTGCTCAGATTCTTTCAGCACTTCAGGGCTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGACTCTTGCACAGAGACCAGCTCGAGCCCCAGGGACAAGGCCATCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGACTCTTGCACAGAGACCAGCTCGAGCCCCAGGGACAAGGCCATCACCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CGCCACTGCCAGAAAGTACTGTGCCCTTCAGCAATGGGGTGCTGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CGCCACTGCCAGAAAGTACTGTGCCCTTCAGCAATGGGGTGCTGAAGGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGTTGTCAGACTTGGGGGCTGAGGATGGATGGACCATGGATGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGTTGTCAGACTTGGGGGCTGAGGATGGATGGACCATGGATGCGGAAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AGATCATTCAGGAG         GTTCTGACAGGAACAGCATGGATTCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101701 AGATCATTCAGGAGGTA...CAGGTTCTGACAGGAACAGCATGGATTCCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 TGGATAGCTGTTGCAGTCTCAAGAAGACTGAGAGCTTCCAAAATGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104588 TGGATAGCTGTTGCAGTCTCAAGAAGACTGAGAGCTTCCAAAATGCCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GCAGGCTCCAACCCTAAGAAGGTCGACCTCATCATCTGGGAGATCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104638 GCAGGCTCCAACCCTAAGAAGGTCGACCTCATCATCTGGGAGATCGAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 GCCAAAG         CACTTAGTCGGTCGGCTAATTGGCAAGCAGGGGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104688 GCCAAAGGTA...AAGCACTTAGTCGGTCGGCTAATTGGCAAGCAGGGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 GCTATGTGAGTTTTCTGAAGCAAACATCTGGTGCCAAGATCTACATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106368 GCTATGTGAGTTTTCTGAAGCAAACATCTGGTGCCAAGATCTACATTTCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 ACCCTGCCTTACACCCAGAGCGTCCAGATCTGCCACATAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106418 ACCCTGCCTTACACCCAGAGCGTCCAGATCTGCCACATAGAAGGTC...T

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1976   GCTCTCAACATCATGTAGACAAAGCGCTGAACTTGATTGGGAAGAAGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107025 AGGCTCTCAACATCATGTAGACAAAGCGCTGAACTTGATTGGGAAGAAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 TCAAAGAGCTGAACCTCACCAATATCTACGCTCCCCCATTGCCTTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107075 TCAAAGAGCTGAACCTCACCAATATCTACGCTCCCCCATTGCCTTCACTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 GCACTGCCTTCTCTGCCGATGACATCCTGG         CTCATGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107125 GCACTGCCTTCTCTGCCGATGACATCCTGGGTG...CAGCTCATGCTGCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 TGATGGCATCACCGTGGAGGTCATTGTGGTCAACCAGGTCAATGCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109006 TGATGGCATCACCGTGGAGGTCATTGTGGTCAACCAGGTCAATGCCGGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 ACCTGTTCGTGCAGCAGCACACACACCCTACCTTCCACGCGCTGCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109056 ACCTGTTCGTGCAGCAGCACACACACCCTACCTTCCACGCGCTGCGCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2215 CTCGACCAGCAGATGTACCTCTGTTACTCTCAGCCTGGAATCCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109106 CTCGACCAGCAGATGTACCTCTGTTACTCTCAGCCTGGAATCCCCACCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2265 GCCCACCCCAGTGGAAA         TAACGGTCATCTGTGCCGCCCCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109156 GCCCACCCCAGTGGAAAGTA...CAGTAACGGTCATCTGTGCCGCCCCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 GTGCGGACGGGGCCTGGTGGCGAGCCCAAGTGGTTGCCTCCTACGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110671 GTGCGGACGGGGCCTGGTGGCGAGCCCAAGTGGTTGCCTCCTACGAGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 ACCAACGAAGTGGAGATTCGATACGTGCACTACGGCGGATATAAGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 110721 ACCAACGAAGTGGAGATTCGATACGTGGACTACGGCGGATATAAGAGGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 GAAAGTAGACGTGCTCCGGCAAATCAG         GTCTGACTTTGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 110771 GAAAGTAGACGTGCTCCGGCAAATCAGGTG...CAGGTCTGACTTTGTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 CCCTGCCGTTTCAGGGAGCAGAAGTCCTTCTGGACAGTGTGATGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111410 CCCTGCCGTTTCAGGGAGCAGAAGTCCTTCTGGACAGTGTGATGCCCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 TCAG         ACGATGACCAGTTTTCACCGGAAGCAGATGCCGCCAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111460 TCAGGTA...AAGACGATGACCAGTTTTCACCGGAAGCAGATGCCGCCAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538 GAGCGAGATGACGGGGAATACAGCACTGCTTGCTCAG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 112954 GAGCGAGATGACGGGGAATACAGCACTGCTTGCTCAGGTG...CAGGTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 CAAGTTACAGTCCAACTGGTCTTCCTCTGATTCAGCTGTGGAGTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113522 CAAGTTACAGTCCAACTGGTCTTCCTCTGATTCAGCTGTGGAGTGTGGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 GGAGATGAA         GTGGTGTTGATAAACCGGTCCCTGGTGGAGCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 113572 GGAGATGAAGTA...TAGGTGGTGTTGATAAACCGGTCCCTGGTGGAGCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :
   2670 AGGCCTTGCCCAGTGGGTAGACAGCTACTACACAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114818 AGGCCTTGCCCAGTGGGTAGACAGCTACTACACAAGCCTT