seq1 = pF1KE1485.tfa, 1269 bp
seq2 = pF1KE1485/gi568815585r_45953617.tfa (gi568815585r:45953617_46205009), 251393 bp

>pF1KE1485 1269
>gi568815585r:45953617_46205009 (Chr13)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-150  (117190-117265)   100% ->
151-275  (120667-120791)   100% ->
276-384  (122461-122569)   99% ->
385-486  (126109-126210)   100% ->
487-591  (131033-131137)   100% ->
592-702  (137593-137703)   99% ->
703-796  (140269-140362)   100% ->
797-999  (146629-146831)   100% ->
1000-1087  (149161-149248)   98% ->
1088-1269  (151212-151393)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTTTGCAGCCTTGCAGTCCTTGTACCCATTGTTCTCTTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTTTGCAGCCTTGCAGTCCTTGTACCCATTGTTCTCTTCTGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCATGTCTTCGCGTTTCAGAG         TGGCCAAGTTCTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 GCAGCATGTCTTCGCGTTTCAGAGGTA...CAGTGGCCAAGTTCTAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCTTCCTAGAACCTCTAGGCAAGTTCAAGTTCTACAGAATCTTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117207 CTCTTCCTAGAACCTCTAGGCAAGTTCAAGTTCTACAGAATCTTACTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACATATGAG         ATTGTTCTCTGGCAGCCGGTAACAGCTGACCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 117257 ACATATGAGGTA...TAGATTGTTCTCTGGCAGCCGGTAACAGCTGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATTGTGAAGAAAAAACAAGTCCATTTTTTTGTAAATGCATCTGATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120699 TATTGTGAAGAAAAAACAAGTCCATTTTTTTGTAAATGCATCTGATGTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAATGTGAAAGCCCATTTAAATGTGAGCGGAATTCCATGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 120749 ACAATGTGAAAGCCCATTTAAATGTGAGCGGAATTCCATGCAGGTA...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   TGTCTTGCTGGCAGACGTGGAAGATCTTATTCAACAGCAGATTTCCAA
        >>||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 122459 AGTGTCTTGCTGGCAGATGTGGAAGATCTTATTCAACAGCAGATTTCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGACACAGTCAGCCCCCGAGCCTCCGCATCGTACTATGAACAGTATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122509 CGACACAGTCAGCCCCCGAGCCTCCGCATCGTACTATGAACAGTATCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACTAAATGAA         ATCTATTCTTGGATAGAATTTATAACTGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 122559 CACTAAATGAAGTA...TAGATCTATTCTTGGATAGAATTTATAACTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGGCATCCTGATATGCTTACAAAAATCCACATTGGATCCTCATTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126139 AGGCATCCTGATATGCTTACAAAAATCCACATTGGATCCTCATTTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTACCCACTCTATGTTTTAAAG         GTTTCTGGAAAAGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 126189 GTACCCACTCTATGTTTTAAAGGTA...CAGGTTTCTGGAAAAGAACAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGCCAAAAATGCCATATGGATTGACTGTGGAATCCATGCCAGAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131052 CAGCCAAAAATGCCATATGGATTGACTGTGGAATCCATGCCAGAGAATGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATCTCTCCTGCTTTCTGCTTGTGGTTCATAGGCCAT         ATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 131102 ATCTCTCCTGCTTTCTGCTTGTGGTTCATAGGCCATGTA...CAGATAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TCAATTCTATGGGATAATAGGGCAATATACCAATCTCCTGAGGCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137598 TCAATTCTATGGGATAATAGGGCAATATACCAATCTCCTGAGGCTTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATTTCTATGTTATGCCGGTGGTTAATGTGGATGGTTATGACTACTCATGG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 137648 ATTTCTATGTTATGCCAGTGGTTAATGTGGATGGTTATGACTACTCATGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAAAAG         AATCGAATGTGGAGAAAGAACCGTTCTTTCTATGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137698 AAAAAGGTA...TAGAATCGAATGTGGAGAAAGAACCGTTCTTTCTATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAACAATCATTGCATCGGAACAGACCTGAATAGGAACTTTGCTTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140304 GAACAATCATTGCATCGGAACAGACCTGAATAGGAACTTTGCTTCCAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACTGGTGTG         AGGAAGGTGCATCCAGTTCCTCATGCTCGGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 140354 ACTGGTGTGGTA...CAGAGGAAGGTGCATCCAGTTCCTCATGCTCGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACCTACTGTGGACTTTATCCTGAGTCAGAACCAGAAGTGAAGGCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146661 ACCTACTGTGGACTTTATCCTGAGTCAGAACCAGAAGTGAAGGCAGTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TAGTTTCTTGAGAAGAAATATCAACCAGATTAAAGCATACATCAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146711 TAGTTTCTTGAGAAGAAATATCAACCAGATTAAAGCATACATCAGCATGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATTCATACTCCCAGCATATAGTGTTTCCATATTCCTATACACGAAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146761 ATTCATACTCCCAGCATATAGTGTTTCCATATTCCTATACACGAAGTAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGCAAAGACCATGAGGAACTG         TCTCTAGTAGCCAGTGAAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 146811 AGCAAAGACCATGAGGAACTGGTA...CAGTCTCTAGTAGCCAGTGAAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGTTCGTGCTATTGAGAAAACTAGTAAAAATACCAGGTATACACATGGCC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 149181 AGTTCGTGCTATTGAGAAAATTAGTAAAAATACCAGGTATACACATGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGGCTCAGAAACCTTAT         ACCTAGCTCCTGGAGGTGGGGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 149231 ATGGCTCAGAAACCTTATGTA...TAGACCTAGCTCCTGGAGGTGGGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GATTGGATCTATGATTTGGGCATCAAATATTCGTTTACAATTGAACTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151235 GATTGGATCTATGATTTGGGCATCAAATATTCGTTTACAATTGAACTTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGATACGGGCACATACGGATTCTTGCTGCCGGAGCGTTACACCAAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 151285 AGATACGGGCACATACGGATTCTTGCTGCCGGAGCGTTACATCAAACCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CCTGTAGAGAAGCTTTTGCCGCTGTCTCTAAAATAGCTTGGCATGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151335 CCTGTAGAGAAGCTTTTGCCGCTGTCTCTAAAATAGCTTGGCATGTCATT

   1350     .
   1261 AGGAATGTT
        |||||||||
 151385 AGGAATGTT