seq1 = pF1KE1471.tfa, 708 bp
seq2 = pF1KE1471/gi568815579f_431932.tfa (gi568815579f:431932_641549), 209618 bp

>pF1KE1471 708
>gi568815579f:431932_641549 (Chr19)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-264  (103906-103992)   100% ->
265-362  (104312-104409)   100% ->
363-497  (105082-105216)   100% ->
498-708  (109408-109618)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGCCGCTAGTGCCCAGCTCGCAGAAGGCGCTGCTGCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGCCGCTAGTGCCCAGCTCGCAGAAGGCGCTGCTGCTGGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGGGCTGCAGGAAGAGCCGGTCGAGGGATTCCGCGTGACACTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGGGCTGCAGGAAGAGCCGGTCGAGGGATTCCGCGTGACACTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGGGCGATCTATACAACTGGGAGGTGGCCATCTTCGGGCCCCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGGGCGATCTATACAACTGGGAGGTGGCCATCTTCGGGCCCCCCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTACTACGAGGGCGGCTACTTCAAG         GCGCGCCTCAAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 ACCTACTACGAGGGCGGCTACTTCAAGGTG...CAGGCGCGCCTCAAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCATCGACTACCCATACTCTCCACCAGCCTTTCGGTTCCTGACCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103920 CCCCATCGACTACCCATACTCTCCACCAGCCTTTCGGTTCCTGACCAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTGGCACCCTAACATCTACGAG         ACGGGGGACGTGTGTATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103970 TGTGGCACCCTAACATCTACGAGGTG...CAGACGGGGGACGTGTGTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCATCCTCCACCCGCCGGTGGACGACCCCCAGAGCGGGGAGCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104330 TCCATCCTCCACCCGCCGGTGGACGACCCCCAGAGCGGGGAGCTGCCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGAGGTGGAACCCCACGCAGAACGTCAG         GACCATTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104380 AGAGAGGTGGAACCCCACGCAGAACGTCAGGTA...CAGGACCATTCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAGTGTGATCTCCCTCCTGAACGAGCCCAACACCTTCTCGCCCGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105093 TGAGTGTGATCTCCCTCCTGAACGAGCCCAACACCTTCTCGCCCGCAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGACGCCTCCGTGATGTACAGGAAGTGGAAAGAGAGCAAGGGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105143 GTGGACGCCTCCGTGATGTACAGGAAGTGGAAAGAGAGCAAGGGGAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCGGGAGTACACAGACATCATCCG         GAAGCAGGTCCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105193 TCGGGAGTACACAGACATCATCCGGTG...CAGGAAGCAGGTCCTGGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAAGGTGGACGCGGAGCGTGACGGCGTGAAGGTGCCCACCACGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109425 CCAAGGTGGACGCGGAGCGTGACGGCGTGAAGGTGCCCACCACGCTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGTACTGCGTGAAGACCAAGGCGCCGGCGCCCGACGAGGGCTCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109475 GAGTACTGCGTGAAGACCAAGGCGCCGGCGCCCGACGAGGGCTCAGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTCTACGACGACTACTACGAGGACGGCGAGGTGGAGGAGGAGGCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109525 CTTCTACGACGACTACTACGAGGACGGCGAGGTGGAGGAGGAGGCCGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCTGCTTCGGGGACGATGAGGATGACTCTGGCACGGAGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109575 GCTGCTTCGGGGACGATGAGGATGACTCTGGCACGGAGGAGTCC