seq1 = pF1KE1463.tfa, 450 bp
seq2 = pF1KE1463/gi568815593f_179694081.tfa (gi568815593f:179694081_179896391), 202311 bp

>pF1KE1463 450
>gi568815593f:179694081_179896391 (Chr5)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-158  (101504-101603)   100% ->
159-229  (101706-101776)   100% ->
230-311  (101861-101942)   100% ->
312-450  (102173-102311)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGACGAGGTAGCTCTACTGGCTGCTGTCACCCTCCTGGGAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGACGAGGTAGCTCTACTGGCTGCTGTCACCCTCCTGGGAGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCAAG         CCTACTTCTCCCTGCAGGTGATCTCGGCGCGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCAAGGTG...CAGCCTACTTCTCCCTGCAGGTGATCTCGGCGCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGCCTTCCGCGTGTCGCCGCCGCTCACCACCGGCCCACCCGAGTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101537 GGGCCTTCCGCGTGTCGCCGCCGCTCACCACCGGCCCACCCGAGTTCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCGTCTACCGAGCCCA         GGTGAACTGCAGCGAGTACTTCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101587 CGCGTCTACCGAGCCCAGTG...CAGGGTGAACTGCAGCGAGTACTTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGTTCCTCGCCACGCTCTGGGTCGCCGGCATCTTCTTTCATGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101730 GCTGTTCCTCGCCACGCTCTGGGTCGCCGGCATCTTCTTTCATGAAGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230       GGGCGGCGGCCCTGTGCGGCCTGGTCTACCTGTTCGCGCGCCTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101780 ...CAGGGGCGGCGGCCCTGTGCGGCCTGGTCTACCTGTTCGCGCGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGCTACTTCCAGGGCTACGCGCGCTCCGCGCAGCTCAG         GCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101905 CGCTACTTCCAGGGCTACGCGCGCTCCGCGCAGCTCAGGTG...CAGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGCACCGCTGTACGCGAGCGCGCGCGCCCTCTGGCTGCTGGTGGCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 GGCACCGCTGTACGCGAGCGCGCGCGCCCTCTGGCTGCTGGTGGCGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTGCGCTCGGCCTGCTCGCCCACTTCCTCCCGGCCGCGCTGCGCGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102226 CTGCGCTCGGCCTGCTCGCCCACTTCCTCCCGGCCGCGCTGCGCGCCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    415 CTCCTCGGACAGCTCCGGACGCTGCTGCCGTGGGCC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 102276 CTCCTCGGACGGCTCCGGACGCTGCTGCCGTGGGCC