seq1 = pF1KE1443.tfa, 1398 bp
seq2 = pF1KE1443/gi568815591r_73203418.tfa (gi568815591r:73203418_73408790), 205373 bp

>pF1KE1443 1398
>gi568815591r:73203418_73408790 (Chr7)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-216  (100238-100360)   100% ->
217-391  (101034-101208)   100% ->
392-500  (101289-101397)   100% ->
501-639  (103694-103832)   100% ->
640-755  (103929-104044)   100% ->
756-934  (104383-104561)   100% ->
935-1145  (104755-104965)   100% ->
1146-1286  (105051-105191)   100% ->
1287-1398  (105262-105373)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGTATGCTGCAGCTGCAGGCGTGTTGGCCGGCGTGGAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTGTATGCTGCAGCTGCAGGCGTGTTGGCCGGCGTGGAGAGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGGCTCTATCAAGGGGTTGGTGTACTCCAGCAACTTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 CCAGGGCTCTATCAAGGGGTTGGTGTACTCCAGCAACTTCCAGGTA...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   AACGTGAAGCAGCTGTACGCGCTGGTGTGCGAAACGCAGCGCTACTCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100236 AGAACGTGAAGCAGCTGTACGCGCTGGTGTGCGAAACGCAGCGCTACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCGTGCTGGATGCTGTGATCGCCAGCGCCGGCCTCCTCCGTGCGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100286 GCCGTGCTGGATGCTGTGATCGCCAGCGCCGGCCTCCTCCGTGCGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCTGCGGCCGCACCTGGCCAAG         GTGCTAGTGTATGAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100336 GAAGCTGCGGCCGCACCTGGCCAAGGTG...CAGGTGCTAGTGTATGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTTGTTGGGAAAGGGCTTTCGAGGGGGTGGGGGCCGATGGAAGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101050 TGTTGTTGGGAAAGGGCTTTCGAGGGGGTGGGGGCCGATGGAAGGCTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGGGCCGGCACCAGGCGAGGCTCAAGGCTGAGTTGGCTCGGCTCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101100 TTGGGCCGGCACCAGGCGAGGCTCAAGGCTGAGTTGGCTCGGCTCAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCATCGGGGTGTGAGCCGGAATGAGGACCTGTTGGAAGTGGGATCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101150 TCATCGGGGTGTGAGCCGGAATGAGGACCTGTTGGAAGTGGGATCCAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGTCCAG         CCTCCCAGCTGCCTCGATTTGTGCGTGTGAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101200 CTGGTCCAGGTA...TAGCCTCCCAGCTGCCTCGATTTGTGCGTGTGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACTCTCAAGACCTGCTCCGATGATGTAGTTGATTATTTCAAGAGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101321 ACTCTCAAGACCTGCTCCGATGATGTAGTTGATTATTTCAAGAGACAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTTCTCCTATCAGGGTCGGGCTTCCAG         CCTCGATGACTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101371 TTTCTCCTATCAGGGTCGGGCTTCCAGGTG...CAGCCTCGATGACTTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCCCTCAAGGGGAAGCATTTTCTCCTGGACCCCTTGATGCCGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103708 GAGCCCTCAAGGGGAAGCATTTTCTCCTGGACCCCTTGATGCCGGAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGTGTTTCCCGCCCAGACAGATCTGCATGAACACCCACTGTACCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103758 CTGGTGTTTCCCGCCCAGACAGATCTGCATGAACACCCACTGTACCGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGGACACCTCATTCTGCAGGACAGG         GCCAGCTGTCTCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103808 CGGACACCTCATTCTGCAGGACAGGGTA...CAGGCCAGCTGTCTCCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCATGCTGCTGGACCCCCCGCCAGGCTCCCATGTCATCGATGCCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103945 CCATGCTGCTGGACCCCCCGCCAGGCTCCCATGTCATCGATGCCTGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCCCAGGCAATAAGACCAGTCACTTGGCTGCTCTTCTGAAGAACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 GCCCCAGGCAATAAGACCAGTCACTTGGCTGCTCTTCTGAAGAACCAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756          GAAGATCTTTGCCTTTGACCTGGATGCCAAGCGGCTGGCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 GTG...TAGGAAGATCTTTGCCTTTGACCTGGATGCCAAGCGGCTGGCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATGGCCACGCTGCTGGCCCGGGCTGGCGTCTCTTGCTGTGAACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104424 CCATGGCCACGCTGCTGGCCCGGGCTGGCGTCTCTTGCTGTGAACTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGGAGGACTTCCTGGCGGTCTCCCCCTCGGATCCACGCTACCATGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104474 GAGGAGGACTTCCTGGCGGTCTCCCCCTCGGATCCACGCTACCATGAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCACTACATCCTGCTGGATCCTTCCTGCAGTGGCTCGG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104524 CCACTACATCCTGCTGGATCCTTCCTGCAGTGGCTCGGGTG...TAGGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGCCGAGCAGACAGCTGGAGGAGCCCGGGGCAGGCACACCTAGCCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104758 TGCCGAGCAGACAGCTGGAGGAGCCCGGGGCAGGCACACCTAGCCCGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGTCTGCATGCCCTGGCAGGGTTCCAGCAGCGAGCCCTGTGCCACGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104808 CGTCTGCATGCCCTGGCAGGGTTCCAGCAGCGAGCCCTGTGCCACGCACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACTTTCCCTTCCCTGCAGCGGCTCGTCTACTCCACGTGCTCCCTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104858 CACTTTCCCTTCCCTGCAGCGGCTCGTCTACTCCACGTGCTCCCTCTGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGAGGAGAATGAAGACGTGGTGCGAGATGCGCTGCAGCAGAACCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104908 AGGAGGAGAATGAAGACGTGGTGCGAGATGCGCTGCAGCAGAACCCGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCCTTCAG         GCTAGCTCCCGCCCTGCCTGCCTGGCCCCACCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104958 GCCTTCAGGTA...CAGGCTAGCTCCCGCCCTGCCTGCCTGGCCCCACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGGCCTGAGCACGTTCCCGGGTGCCGAGCACTGCCTCCGGGCCTCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105084 AGGCCTGAGCACGTTCCCGGGTGCCGAGCACTGCCTCCGGGCCTCCCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGACCACACTCAGCAGTGGCTTCTTCGTTGCTGTAATTGAACGGGTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105134 AGACCACACTCAGCAGTGGCTTCTTCGTTGCTGTAATTGAACGGGTCGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTGCCAAG         CTCAGCCTCACAGGCCAAAGCATCAGCACCAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105184 GTGCCAAGGTG...TAGCTCAGCCTCACAGGCCAAAGCATCAGCACCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACGCACACCCAGCCCAGCCCCAAAGAGAAAGAAGAGACAGCAAAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105295 ACGCACACCCAGCCCAGCCCCAAAGAGAAAGAAGAGACAGCAAAGAGCCG

   1450     .    :    .    :    .
   1370 CAGCCGGTGCTTGCACACCGCCTTGCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 105345 CAGCCGGTGCTTGCACACCGCCTTGCACA