seq1 = pF1KE1441.tfa, 1236 bp seq2 = pF1KE1441/gi568815577r_42750052.tfa (gi568815577r:42750052_42979495), 229444 bp >pF1KE1441 1236 >gi568815577r:42750052_42979495 (Chr21) (complement) 1-89 (100001-100089) 100% -> 90-155 (102729-102794) 100% -> 156-296 (105805-105945) 100% -> 297-453 (115900-116056) 99% -> 454-566 (117102-117214) 100% -> 567-627 (119774-119834) 100% -> 628-726 (123716-123814) 100% -> 727-791 (124870-124934) 100% -> 792-975 (125744-125927) 100% -> 976-1045 (127172-127241) 100% -> 1046-1236 (129254-129444) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCGGGCTCTGTGGGACTGGCGTTGTGCGGGCAGACGTTGGTGGTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCGGGCTCTGTGGGACTGGCGTTGTGCGGGCAGACGTTGGTGGTGCG 50 . : . : . : . : . : 51 GGGCGGCAGCCGATTCCTGGCCACCTCCATAGCAAGCAG TG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 100051 GGGCGGCAGCCGATTCCTGGCCACCTCCATAGCAAGCAGGTG...TAGTG 100 . : . : . : . : . : 92 ATGATGACAGCCTCTTCATCTATGACTGCAGTGCTGCAGAAAAGAAGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102731 ATGATGACAGCCTCTTCATCTATGACTGCAGTGCTGCAGAAAAGAAGTCA 150 . : . : . : . : . : 142 CAAGAAAATAAAGG GGAGGACGCGCCCTTGGACCAGGGGAG ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 102781 CAAGAAAATAAAGGGTG...CAGGGAGGACGCGCCCTTGGACCAGGGGAG 200 . : . : . : . : . : 183 CGGTGCGATTCTGGCGTCCACCTTCTCCAAGTCTGGCAGCTATTTTGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105832 CGGTGCGATTCTGGCGTCCACCTTCTCCAAGTCTGGCAGCTATTTTGCTT 250 . : . : . : . : . : 233 TAACCGATGACAGTAAGCGTCTGATTCTTTTCCGTACAAAACCATGGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105882 TAACCGATGACAGTAAGCGTCTGATTCTTTTCCGTACAAAACCATGGCAA 300 . : . : . : . : . : 283 TGTCTGAGTGTCAG GACCGTGGCAAGGAGGTGTACAGCCCT ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 105932 TGTCTGAGTGTCAGGTA...TAGGACCGTGGCAAGGAGGTGTACAGCCCT 350 . : . : . : . : . : 324 GACTTTCATAGCCTCGGAGGAGAAGGTCTTGGTGGCCGACAAGTCTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115927 GACTTTCATAGCCTCGGAGGAGAAGGTCTTGGTGGCCGACAAGTCTGGAG 400 . : . : . : . : . : 374 ACGTCTACTCCTTTTCGGTGCTGGAGCCACACGGGTGTGGCCGTCTAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115977 ACGTCTACTCCTTTTCGGTGCTGGAGCCACACGGGTGTGGCCGTCTAGAG 450 . : . : . : . : . : 424 CTGGGACACCTGTCTATGCTGTTAGATGTG GCTGTGAGTCC ||||| ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 116027 CTGGGGCACCTGTCTATGCTGTTAGATGTGGTA...CAGGCTGTGAGTCC 500 . : . : . : . : . : 465 TGATGACCGCTTCATCCTCACTGCCGACCGGGACGAGAAGATCCGAGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117113 TGATGACCGCTTCATCCTCACTGCCGACCGGGACGAGAAGATCCGAGTCA 550 . : . : . : . : . : 515 GCTGGGCCGCGGCGCCCCATAGCATCGAGTCCTTCTGCTTGGGGCACACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117163 GCTGGGCCGCGGCGCCCCATAGCATCGAGTCCTTCTGCTTGGGGCACACA 600 . : . : . : . : . : 565 GA GTTTGTGAGCCGTATCTCCGTGGTGCCAACTCAGCCCGG ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117213 GAGTG...CAGGTTTGTGAGCCGTATCTCCGTGGTGCCAACTCAGCCCGG 650 . : . : . : . : . : 606 GCTGCTTCTGTCCTCCTCTGGG GACGGCACCCTGAGGCTCT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 119813 GCTGCTTCTGTCCTCCTCTGGGGTA...CAGGACGGCACCCTGAGGCTCT 700 . : . : . : . : . : 647 GGGAGTACAGGAGCGGCCGCCAGCTGCACTGCTGTCACCTGGCCAGTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123735 GGGAGTACAGGAGCGGCCGCCAGCTGCACTGCTGTCACCTGGCCAGTCTG 750 . : . : . : . : . : 697 CAGGAGCTGGTGGACCCCCAGGCCCCCCAG AAGTTTGCCGC ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 123785 CAGGAGCTGGTGGACCCCCAGGCCCCCCAGGTA...TAGAAGTTTGCCGC 800 . : . : . : . : . : 738 GTCCAGGATTGCATTCTGGTGCCAGGAGAACTGCGTGGCGCTCCTGTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124881 GTCCAGGATTGCATTCTGGTGCCAGGAGAACTGCGTGGCGCTCCTGTGCG 850 . : . : . : . : . : 788 ACGG CACTCCTGTGGTCTACATCTTCCAGCTGGACGCCCGC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124931 ACGGGTA...AAGCACTCCTGTGGTCTACATCTTCCAGCTGGACGCCCGC 900 . : . : . : . : . : 829 AGACAGCAGTTGGTGTACAGGCAGCAGCTGGCGTTCCAGCACCAAGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125781 AGACAGCAGTTGGTGTACAGGCAGCAGCTGGCGTTCCAGCACCAAGTGTG 950 . : . : . : . : . : 879 GGACGTGGCTTTCGAGGAGACCCAGGGGCTGTGGGTGCTCCAGGACTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125831 GGACGTGGCTTTCGAGGAGACCCAGGGGCTGTGGGTGCTCCAGGACTGCC 1000 . : . : . : . : . : 929 AGGAAGCCCCCCTGGTGCTCTACAGGCCTGTGGGCGACCAGTGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 125881 AGGAAGCCCCCCTGGTGCTCTACAGGCCTGTGGGCGACCAGTGGCAGGTG 1050 . : . : . : . : . : 976 TCTGTTCCTGAGAGCACCGTGTTAAAGAAAGTCTCTGGTGTTCT ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125931 ...CAGTCTGTTCCTGAGAGCACCGTGTTAAAGAAAGTCTCTGGTGTTCT 1100 . : . : . : . : . : 1020 TCGTGGGAACTGGGCCATGCTGGAAG GCTCTGCCGGCGCAG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 127216 TCGTGGGAACTGGGCCATGCTGGAAGGTG...CAGGCTCTGCCGGCGCAG 1150 . : . : . : . : . : 1061 ACGCCAGCTTCAGCAGTCTCTACAAGGCCACGTTCGACAACGTGACCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129269 ACGCCAGCTTCAGCAGTCTCTACAAGGCCACGTTCGACAACGTGACCTCC 1200 . : . : . : . : . : 1111 TACCTGAAGAAGAAAGAGGAGAGACTGCAGCAGCAGCTAGAGAAGAAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129319 TACCTGAAGAAGAAAGAGGAGAGACTGCAGCAGCAGCTAGAGAAGAAGCA 1250 . : . : . : . : . : 1161 GCGGCGCCGGAGTCCCCCGCCTGGGCCCGACGGGCATGCCAAGAAGATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129369 GCGGCGCCGGAGTCCCCCGCCTGGGCCCGACGGGCATGCCAAGAAGATGA 1300 . : . : . 1211 GACCGGGGGAGGCGACGCTAAGTTGC |||||||||||||||||||||||||| 129419 GACCGGGGGAGGCGACGCTAAGTTGC