seq1 = pF1KE1439.tfa, 387 bp
seq2 = pF1KE1439/gi568815582f_2920398.tfa (gi568815582f:2920398_3121823), 201426 bp

>pF1KE1439 387
>gi568815582f:2920398_3121823 (Chr16)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-199  (100818-100922)   100% ->
200-334  (101158-101292)   100% ->
335-387  (101374-101426)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGGGCTCGCTGCGCCGGTTGCTGCGGCTCCTCGTGCTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGGGCTCGCTGCGCCGGTTGCTGCGGCTCCTCGTGCTGGGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCTGGCGTTGCTGCGCTCCGTGGCCGGGGAGCAAGCGCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 CTGGCTGGCGTTGCTGCGCTCCGTGGCCGGGGAGCAAGCGCCAGGTA...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    GCACCGCCCCCTGCTCCCGCGGCAGCTCCTGGAGCGCGGACCTGGAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100815 CAGGCACCGCCCCCTGCTCCCGCGGCAGCTCCTGGAGCGCGGACCTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTGCATGGACTGCGCGTCTTGCAGGGCGCGACCGCACAGCGACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 AAGTGCATGGACTGCGCGTCTTGCAGGGCGCGACCGCACAGCGACTTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGGCT         GCGCTGCAGCACCTCCTGCCCCCTTCCGGCTGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100915 CCTGGGCTGTG...CAGGCGCTGCAGCACCTCCTGCCCCCTTCCGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTTGGCCCATCCTTGGGGGCGCTCTGAGCCTGACCTTCGTGCTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101191 TTTGGCCCATCCTTGGGGGCGCTCTGAGCCTGACCTTCGTGCTGGGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTTCTGGCTTTTTGGTCTGGAGACGATGCCGCAGGAGAGAGAAGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101241 CTTTCTGGCTTTTTGGTCTGGAGACGATGCCGCAGGAGAGAGAAGTTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CA         CCCCCATAGAGGAGACCGGCGGAGAGGGCTGCCCAGCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101291 CAGTA...CAGCCCCCATAGAGGAGACCGGCGGAGAGGGCTGCCCAGCTG

    400     .    :
    374 TGGCGCTGATCCAG
        ||||||||||||||
 101413 TGGCGCTGATCCAG