seq1 = pF1KE1432.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KE1432/gi568815596r_9306837.tfa (gi568815596r:9306837_9518697), 211861 bp

>pF1KE1432 600
>gi568815596r:9306837_9518697 (Chr2)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-151  (104442-104520)   100% ->
152-288  (106293-106429)   100% ->
289-381  (110493-110585)   100% ->
382-531  (111100-111249)   99% ->
532-600  (111793-111861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCGCAAGGGCAAAAAACGACACAGTAGTAGCAGTTCCCAAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTCGCAAGGGCAAAAAACGACACAGTAGTAGCAGTTCCCAAAGTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAATCAGTACTAAGAGCAAG         TCTGTGGATTCTAGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CGAAATCAGTACTAAGAGCAAGGTA...CAGTCTGTGGATTCTAGCCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGGTCTTTCACGATCCAGCACTGTGGCCAGCCTCGACACAGATTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104461 GGGGTCTTTCACGATCCAGCACTGTGGCCAGCCTCGACACAGATTCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAGCTCAG         GACAAAGCAACAATAATTCAGATACCTGTGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104511 AAAAGCTCAGGTA...CAGGACAAAGCAACAATAATTCAGATACCTGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAATTTCGAATAAAATATGTTGGTGCCATTGAGAAACTGAAACTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106324 AGAATTTCGAATAAAATATGTTGGTGCCATTGAGAAACTGAAACTCTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGGAAAAGGCCTTGAAGGGCCATTAGACCTGATAAATTATATAGACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106374 AGGGAAAAGGCCTTGAAGGGCCATTAGACCTGATAAATTATATAGACGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCCAG         CAAGATGGAAAGTTGCCTTTTGTTCCTCCGGAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106424 GCCCAGGTA...AAGCAAGATGGAAAGTTGCCTTTTGTTCCTCCGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAATTTATTATGGGAGTTTCCAAGTATGGCATAAAAGTATCAACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110528 AGAATTTATTATGGGAGTTTCCAAGTATGGCATAAAAGTATCAACATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCAATAT         GATGTTTTGCACAGGCATGCTCTCTACTTAATA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110578 ATCAATATGTA...CAGGATGTTTTGCACAGGCATGCTCTCTACTTAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCCGGATGGTGTGTTACGATGACGGTCTGGGGGTGGGAAAAAGCTTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 111133 ATCCGGATGGTGTGTTACGATGACGGTCTGGGGGCGGGAAAAAGCTTACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCTCTGAAGACCACAGATGCAAGCAATGAGGAATACAGCCTGTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111183 GGCTCTGAAGACCACAGATGCAAGCAATGAGGAATACAGCCTGTGGGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCAGTGCAACAGCCTG         GAACAAGCACAAGCCATTTGCAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111233 ATCAGTGCAACAGCCTGGTG...TAGGAACAAGCACAAGCCATTTGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    556 GTTTTATCCACCGCTTTTGACTCTGTATTAACATCTGAGAAACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111817 GTTTTATCCACCGCTTTTGACTCTGTATTAACATCTGAGAAACCC