seq1 = pF1KE1425.tfa, 1092 bp
seq2 = pF1KE1425/gi568815579f_51125119.tfa (gi568815579f:51125119_51339685), 214567 bp

>pF1KE1425 1092
>gi568815579f:51125119_51339685 (Chr19)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-418  (100100-100480)   99% ->
419-697  (100685-100963)   100% ->
698-745  (101191-101238)   100% ->
746-842  (110039-110135)   100% ->
843-924  (110477-110558)   100% ->
925-1092  (114400-114567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTGCTGCTACTGCTGCCCCTGCTGTGGGCAG         GGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGCCGCTGCTGCTACTGCTGCCCCTGCTGTGGGCAGGTG...CAGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTGGCTATGGATCCAAATTTCTGGCTGCAAGTGCAGGAGTCAGTGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100104 CCTGGCTATGGATCCAAATTTCTGGCTGCAAGTGCAGGAGTCAGTGACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TACAGGAGGGTTTGTGCGTCCTCGTGCCCTGCACTTTCTTCCATCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100154 TACAGGAGGGTTTGTGCGTCCTCGTGCCCTGCACTTTCTTCCATCCCATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTACTACGACAAGAACTCCCCAGTTCATGGTTACTGGTTCCGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100204 CCCTACTACGACAAGAACTCCCCAGTTCATGGTTACTGGTTCCGGGAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCATTATATCCGGGGACTCTCCAGTGGCCACAAACAAGCTAGATCAAG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 AGCCATTATATCCAGGGACTCTCCAGTGGCCACAAACAAGCTAGATCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGTACAGGAGGAGACTCAGGGCAGATTCCGCCTCCTTGGGGATCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100304 AAGTACAGGAGGAGACTCAGGGCAGATTCCGCCTCCTTGGGGATCCCAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGAACAACTGCTCCCTGAGCATCGTAGACGCCAGGAGGAGGGATAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100354 AGGAACAACTGCTCCCTGAGCATCGTAGACGCCAGGAGGAGGGATAATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCATACTTCTTTCGGATGGAGAGAGGAAGTACCAAATACAGTTACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 TTCATACTTCTTTCGGATGGAGAGAGGAAGTACCAAATACAGTTACAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTCCCCAGCTCTCTGTGCATGTGACAG         ACTTGACCCACAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100454 CTCCCCAGCTCTCTGTGCATGTGACAGGTG...TAGACTTGACCCACAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCAAAATCCTCATCCCTGGCACTCTAGAACCCGGCCACTCCAAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 CCCAAAATCCTCATCCCTGGCACTCTAGAACCCGGCCACTCCAAAAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GACCTGCTCTGTGTCCTGGGCCTGTGAGCAGGGAACACCCCCGATCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 GACCTGCTCTGTGTCCTGGGCCTGTGAGCAGGGAACACCCCCGATCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTGGTTGTCAGCTGCCCCCACCTCCCTGGGCCCCAGGACTACTCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 CCTGGTTGTCAGCTGCCCCCACCTCCCTGGGCCCCAGGACTACTCACTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCGGTGCTCATAATCACCCCACGGCCCCAGGACCACGGCACCAACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 TCGGTGCTCATAATCACCCCACGGCCCCAGGACCACGGCACCAACCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTGTCAGGTGAAGTTCGCTGGAGCTGGTGTGACTACGGAGAGAACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 CTGTCAGGTGAAGTTCGCTGGAGCTGGTGTGACTACGGAGAGAACCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCTCAACGTCACCT         ATGTTCCACAGAACCCAACAACTGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100949 AGCTCAACGTCACCTGTA...TAGATGTTCCACAGAACCCAACAACTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATCTTTCCAGGAGATGGCTCAG         GGAAACAAGAGACCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101217 ATCTTTCCAGGAGATGGCTCAGGTA...CAGGGAAACAAGAGACCAGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGGAGTGGTTCATGGGGCCATTGGAGGAGCTGGTGTTACAGCCCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110058 AGGAGTGGTTCATGGGGCCATTGGAGGAGCTGGTGTTACAGCCCTGCTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCTTTGTCTCTGCCTCATCTTCTTCAT         AGTGAAGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 110108 CTCTTTGTCTCTGCCTCATCTTCTTCATGTG...CAGAGTGAAGACCCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGGAGGAAAGCAGCCAGGACAGCAGTGGGCAGGAATGACACCCACCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110490 AGGAGGAAAGCAGCCAGGACAGCAGTGGGCAGGAATGACACCCACCCTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CACAGGGTCAGCCTCCCCG         AAACACCAGAAGAAGTCCAAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 110540 CACAGGGTCAGCCTCCCCGGTG...AAGAAACACCAGAAGAAGTCCAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TACATGGCCCCACTGAAACCTCAAGCTGTTCAGGTGCCGCCCCTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114422 TACATGGCCCCACTGAAACCTCAAGCTGTTCAGGTGCCGCCCCTACTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGATGGATGAGGAGCTGCATTATGCTTCCCTCAACTTTCATGGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114472 GAGATGGATGAGGAGCTGCATTATGCTTCCCTCAACTTTCATGGGATGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1047 TCCTTCCAAGGACACCTCCACCGAATACTCAGAGGTCAGGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114522 TCCTTCCAAGGACACCTCCACCGAATACTCAGAGGTCAGGACCCAG