seq1 = pF1KE1424.tfa, 1668 bp
seq2 = pF1KE1424/gi568815592r_159679048.tfa (gi568815592r:159679048_159889468), 210421 bp

>pF1KE1424 1668
>gi568815592r:159679048_159889468 (Chr6)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-150  (101326-101411)   100% ->
151-279  (101598-101726)   100% ->
280-377  (103472-103569)   100% ->
378-488  (103973-104083)   100% ->
489-670  (104622-104803)   100% ->
671-797  (105402-105528)   100% ->
798-973  (108359-108534)   100% ->
974-1097  (108903-109026)   100% ->
1098-1290  (109382-109574)   100% ->
1291-1454  (109679-109842)   100% ->
1455-1668  (110208-110421)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGGGCCTTTGTCCGTGTTCGGTGACCGCAGCACTGGGGAAACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGGGCCTTTGTCCGTGTTCGGTGACCGCAGCACTGGGGAAACGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTCCCAAAACG         TTATGGCTGCAGCTTCGATTGCCAATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTCCCAAAACGGTA...CAGTTATGGCTGCAGCTTCGATTGCCAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGTAAAAAGTTCTCTTGGTCCAGTTGGCTTGGATAAAATGTTGGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101353 TTGTAAAAAGTTCTCTTGGTCCAGTTGGCTTGGATAAAATGTTGGTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATATTGGT         GATGTAACCATTACTAACGATGGTGCAACCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101403 GATATTGGTGTA...TAGGATGTAACCATTACTAACGATGGTGCAACCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGAAGTTACTGGAGGTAGAACATCCTGCAGCTAAAGTTCTTTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 CCTGAAGTTACTGGAGGTAGAACATCCTGCAGCTAAAGTTCTTTGTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCTGATCTGCAAGACAAAGAAGTTGGAGATGGAACTACTTCAGTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101680 TGGCTGATCTGCAAGACAAAGAAGTTGGAGATGGAACTACTTCAGTGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       GTTATTATTGCAGCAGAACTCCTAAAAAATGCAGATGAATTAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101730 ...CAGGTTATTATTGCAGCAGAACTCCTAAAAAATGCAGATGAATTAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAACAGAAAATTCATCCCACATCAGTTATTAGTGGCTATCGACTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103516 CAAACAGAAAATTCATCCCACATCAGTTATTAGTGGCTATCGACTTGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCAA         GGAAGCAGTGCGTTATATCAATGAAAACCTAATTGTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103566 GCAAGTA...CAGGGAAGCAGTGCGTTATATCAATGAAAACCTAATTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AACACAGATGAACTGGGAAGAGATTGCCTGATTAATGCTGCTAAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104010 AACACAGATGAACTGGGAAGAGATTGCCTGATTAATGCTGCTAAGACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGTCTTCCAAAATCATTGGAAT         AAATGGTGATTTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104060 CATGTCTTCCAAAATCATTGGAATGTA...TAGAAATGGTGATTTCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTAACATGGTAGTAGATGCTGTACTTGCTATTAAATACACAGACATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104639 CTAACATGGTAGTAGATGCTGTACTTGCTATTAAATACACAGACATAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCCAGCCACGCTATCCAGTCAACTCTGTTAATATTTTGAAAGCCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104689 GGCCAGCCACGCTATCCAGTCAACTCTGTTAATATTTTGAAAGCCCATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAGAAGTCAAATGGAGAGTATGCTCATCAGTGGCTATGCACTCAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104739 GAGAAGTCAAATGGAGAGTATGCTCATCAGTGGCTATGCACTCAACTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTGGGATCCCAGG         GCATGCCCAAGAGAATCGTAAATGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104789 TGGTGGGATCCCAGGGTA...TAGGCATGCCCAAGAGAATCGTAAATGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAAATTGCTTGCCTTGACTTCAGCCTGCAAAAAACAAAAATGAAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105428 AAAATTGCTTGCCTTGACTTCAGCCTGCAAAAAACAAAAATGAAGCTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGTACAGGTGGTCATTACAGACCCTGAAAAACTGGACCAAATTAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105478 TGTACAGGTGGTCATTACAGACCCTGAAAAACTGGACCAAATTAGACAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 G         AGAATCAGATATCACCAAGGAGAGAATTCAGAAGATCCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105528 GGTA...CAGAGAATCAGATATCACCAAGGAGAGAATTCAGAAGATCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCAACTGGTGCCAATGTTATTCTAACCACTGGTGGAATTGATGATATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108399 GCAACTGGTGCCAATGTTATTCTAACCACTGGTGGAATTGATGATATGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTGAAGTATTTTGTGGAGGCTGGTGCTATGGCAGTTAGAAGAGTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108449 TCTGAAGTATTTTGTGGAGGCTGGTGCTATGGCAGTTAGAAGAGTTTTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAAGGGACCTTAAACGCATTGCCAAAGCTTCTGGAG         CAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108499 AAAGGGACCTTAAACGCATTGCCAAAGCTTCTGGAGGTA...TAGCAACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATTCTGTCAACCCTGGCCAATTTGGAAGGTGAAGAAACTTTTGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108908 ATTCTGTCAACCCTGGCCAATTTGGAAGGTGAAGAAACTTTTGAAGCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AATGTTGGGACAGGCAGAAGAAGTGGTACAGGAGAGAATTTGTGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108958 AATGTTGGGACAGGCAGAAGAAGTGGTACAGGAGAGAATTTGTGATGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCTGATCTTAATCAAAAA         TACTAAGGCTCGTACGTCTGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109008 AGCTGATCTTAATCAAAAAGTA...CAGTACTAAGGCTCGTACGTCTGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCGATTATCTTACGTGGGGCAAATGATTTCATGTGTGATGAGATGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109404 TCGATTATCTTACGTGGGGCAAATGATTTCATGTGTGATGAGATGGAGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTCTTTACATGATGCACTTTGTGTAGTGAAGAGAGTTTTGGAGTCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109454 CTCTTTACATGATGCACTTTGTGTAGTGAAGAGAGTTTTGGAGTCAAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTGTGGTTCCCGGTGGGGGTGCTGTAGAAGCAGCCCTTTCCATATACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109504 CTGTGGTTCCCGGTGGGGGTGCTGTAGAAGCAGCCCTTTCCATATACCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAAAACTATGCAACCAGCATG         GGGTCTCGGGAACAGCTTGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109554 GAAAACTATGCAACCAGCATGGTA...TAGGGGTCTCGGGAACAGCTTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GATTGCAGAGTTTGCAAGATCACTTCTTGTTATTCCCAATACACTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109699 GATTGCAGAGTTTGCAAGATCACTTCTTGTTATTCCCAATACACTAGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTAATGCTGCCCAGGACTCCACAGATCTGGTTGCAAAATTAAGAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109749 TTAATGCTGCCCAGGACTCCACAGATCTGGTTGCAAAATTAAGAGCTTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CATAATGAGGCCCAGGTTAACCCAGAACGTAAAAATCTAAAATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109799 CATAATGAGGCCCAGGTTAACCCAGAACGTAAAAATCTAAAATGGTA...

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1455    GATTGGTCTTGATTTGAGCAATGGTAAACCTCGAGACAACAAACAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110205 CAGGATTGGTCTTGATTTGAGCAATGGTAAACCTCGAGACAACAAACAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CAGGGGTGTTTGAACCAACCATAGTTAAAGTTAAGAGTTTGAAATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110255 CAGGGGTGTTTGAACCAACCATAGTTAAAGTTAAGAGTTTGAAATTTGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ACAGAAGCTGCAATCACCATTCTTCGAATTGATGATCTTATTAAATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110305 ACAGAAGCTGCAATCACCATTCTTCGAATTGATGATCTTATTAAATTACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TCCAGAAAGTAAAGATGATAAACATGGAAGTTATGAAGATGCTGTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110355 TCCAGAAAGTAAAGATGATAAACATGGAAGTTATGAAGATGCTGTTCACT

   1750     .    :    .
   1652 CTGGAGCCCTTAATGAT
        |||||||||||||||||
 110405 CTGGAGCCCTTAATGAT